Первоначально «Меерсбург» использовался на Балтике в учебных целях в качестве корабля-цели для 27-й флотилии подводных лодок. В 1942 г. было принято решение перестроить его во вспомогательный крейсер. Судно вначале направили на голландскую верфь «Вилтон-Фейеноорд», а затем перевели на гамбургскую «Блом унд Фосс».
Работы велись с учетом накопленного за почти три года опыта переоборудования и использования кораблей этого класса. «Шифф-5» получил наиболее сильное вооружение из восьми 150-мм орудий и большого количества малокалиберных автоматических пушек, а также множество технических новинок: автоматизированный пост центральной наводки артиллерии, два радара (обнаружения целей и орудийной наводки), гидролокатор и катапульту для гидросамолета. Значительную часть экипажа, около 80 %, составили моряки со злосчастного «Штира». Первоначально подготовкой корабля к плаванию и комплектацией экипажа занимался бывший командир «Штира» капитан-цур-зее Герлах, которого с апреля 1943 г. сменил капитан-цур-зее Ганс Хенигст. Перестройка постоянно затягивалась из-за нехватки материалов на верфи и отсутствия квалифицированных рабочих, занятых куда более важными работами. 25 июля 1943 г., когда авиация союзников нанесла бомбовый удар по Гамбургу, судно получило повреждения. Это оказалось последней каплей, и РВМ приняло решение прекратить работы по перестройке.
В конце 1943 г. новым командиром «Шифф-5» стал капитан-цур-зее Фриц Швёрер, который оставался в должности до конца войны. 29 февраля 1944 г. несостоявшийся рейдер наконец-то вошел в состав 2-й учебной дивизии подводных лодок как учебное судно и корабль-цель под новым названием «Ганза». До конца войны он действовал на Балтике, принимая участие в эвакуации из Таллина в августе 1944 г. и Хелы в самом конце войны, 4 мая 1945 г. получил повреждения от подрыва на мине в Балтийском море. По окончании военных действий, судно попало под контроль британского Адмиралтейства, и было переименовано в «Эмпайр Хамбер». В свою очередь, судоходная компания Альфреда Холта, потерявшая за годы войны 52 судна, попробовала вернуть себе бывший «Гленгарри». Однако представителям компании не удалось договориться с бюрократами Адмиралтейства о его передаче, и тогда один из ее капитанов, Фрэнк С. Браун, просто-напросто… угнал транспорт, стоявший на отстое в шотландском Джарлохе. Ему вернули прежнее наименование «Гленгарри», под которым он плавал до 1970 г. Затем на краткий промежуток времени, менее года, его переименовали в «Дарданус», но с наступлением 1971 г. старое имя вернули, а уже в феврале транспорт был продан на слом.
О других судах, готовившихся стать коммерческими рейдерами, имеется гораздо меньше информации. Карл Август Мюггенталер указывает, что в 1938–1939 гг. в планах на случай начала боевых действий фигурировало 26 судов, предполагавшихся к перестройке во вспомогательные крейсера. Он же приводит сведения, что одновременно с мобилизацией «Курмарка», «Ноймарка» и «Гольденфельса» был отдан приказ начать работы на двух недостроенных судах водоизмещением 3000 т, однако потом от этого отказались, посчитав, что они слишком малы и окажутся легковооруженными. Первоначально входивший в список «Иллер» затем заменили однотипным «Эмсом». Известный немецкий историк флота Тео Доргайст сообщает, что мобилизационный план составлялся в РВМ сроком только на месяц, и в него постоянно вносились коррективы, поэтому точного перечня никогда не существовало. Эрих Тренер в своем справочнике приводит наименования всего шести судов: «Найденфельс», «Мольткефельс» (однотипные с «Атлантисом»), «Амерскерк» («Шифф-49»), «Минден» (бывший «Лодзь», однотипный с «Михелем»), «Кобург» и «Марбург» (два последних — новой постройки). Из этого можно сделать вывод, что, по крайней мере, вся серия сухогрузов типа «Эренфельс» компании «Ганза», к которой принадлежали «Атлантис» и «Пингвин», планировалась к переоборудованию во вспомогательные крейсера.
18 мая 1942 г. Командный отдел ОКМ представил в РВМ информацию о дальнейших планах в отношении переоборудования торговых судов во вспомогательные крейсера, с учетом неудовлетворительного положения верфей и из-за отсутствия у флота необходимого количества материалов (особенно цветных металлов, в частности меди). На ее основе были приняты решения:
1) отказаться от планов перестройки в HSK трех однотипных судов, строящихся для NDL на верфи «Кокрилл» в Антверпене (строительные номера 2312, 2313 и 2314);
2) срочно начать в особом режиме перестройку «Шифф-49» («Амерскерк») в HSK-12 на верфи «Вилтон-Фейеноорд» в Схидаме;
3) отказаться от перестройки в HSK по проекту «Шифф-49» («Амерскерк») однотипных с ним «Аннекерк» и «Арендскерк»;
4) в случае необходимости начать перестройку в HSK по подобию «Шифф-49» транспортов «Мольткефельс» и «Найденфельс», однотипных с «Атлантисом» и «Пингвином», и планировавшихся к перестройке еще в 1940 г. На работы предполагается не более шести месяцев;
5) находящиеся в Голландии материалы для предполагавшейся постройки теплоходов «Аннекерк» и «Арендскерк», могут использоваться, в случае необходимости, для работ на «Шифф-49», «Мольткефельсе» и «Найденфельсе».
Однако все эти планы остались только на бумаге. Судьба упомянутых здесь судов сложилась по-разному:
«Амерскерк» («Шифф-49») — 21 ноября 1942 г. прибыл для перестройки в HSK-12 на верфи «Вилтон-Фейеноорд» в Схидаме. Работы не завершены, переоборудован в судно-цель. 15 июня 1944 г. во время перехода из Схидама в Гамбург потоплен британскими торпедоносцами «Бофайтер» у голландского острова Скирмонниког (53°35′ с.ш./6°10′ в.д.).
«Иллер» — 9 октября 1944 г. потоплен авиацией у острова Эзель.
«Кобург» — спущен на воду в 1944 г., вошел в строй в 1946 г. Служил под различными флагами, разобран в 1979 г.
«Марбург» — достроен в 1946 г. Служил под различными флагами, разобран в 1978 г.
«Минден» — использовался Кригсмарине как судно-цель. После окончания войны был захвачен англичанами и переименован в «Эмпайр Нидд». В 1947 г. передан Польше как «Генерал Вальтер», пошел на слом в 1970 г. в Гонконге.
«Мольткефельс» — 11 апреля 1945 г. в Хеле атакован советской авиацией, загорелся и выбросился на берег. После войны не восстанавливался и был разобран на металл.
«Найденфельс» — после окончания войны был захвачен англичанами и переименован в «Эмпайр Ди». В 1946 г. передан СССР как «Адмирал Ушаков». В октябре 1975 г. разобран в Сплите.
Итак, 17 октября 1943 г. — с гибелью «Михеля» — рейдерские операции Кригсмарине, продолжавшиеся три с половиной года, закончились. Руководство войной на море, ведшее игру на огромной шахматной доске мирового океана с помощью рейдеров, судов снабжения и блокадопрорывателей, проиграло партию британскому Адмиралтейству. Тем не менее, до самого конца войны РВМ не прекращало изучать результаты деятельности коммерческих рейдеров. Штабисты анализировали Журналы боевых действий и другие документы, готовя на их основе секретные приказы, циркуляры и сводки, касающиеся описания и анализа действий крейсеров. Эта работа так и осталась не оконченной.