29 сентября 1999 года — федеральные войска перешли границу с Чечней и начали военные действия (точнее, продолжили, но уже на территории ЧР) против чеченских боевиков. Войска быстро доходят через степную Чечню к Тереку. Впереди Грозный.
22 октября 1999 года — в Грозном происходит несколько взрывов, в результате которых, по данным чеченской стороны, погибли 137 человек, 250 получили ранения. Это уже поработали наши, российские диверсанты.
Декабрь 1999 — февраль 2000 года — проходит трудная операция по взятию Грозного.
7 февраля 2000 года — министр обороны Игорь Сергеев заявил, что освобождение Грозного завершено. Министр сообщил, что за минувшие сутки в Чечне уничтожено около 450 боевиков.
21 февраля 2000 года — мощный взрыв вечером на южной окраине столицы Дагестана Махачкалы с целью покушения на начальника махачкалинской погранслужбы РФ генерал-майора Сергея Бондарева. Генерал-майор не пострадал.
13 марта 2000 года — взятие в Чечне полевого командира Салмана Радуева федеральными войсками, после чего он был помещен в СИЗО «Лефортово» в Москве.
21 апреля — Геннадий Трошев назначен командующим объединенной группировки федеральных войск на Северном Кавказе.
1 мая 2000 г. — неудачная попытка покушения на муфтия Чечни Ахмада Кадырова.
18 мая — указом президента Виктор Казанцев назначен полномочным представителем президента России в Северо-Кавказском федеральном округе. (Вскоре был переименован в Южный федеральный округ.)
30 мая — в результате теракта погибли заместитель представителя правительства в Чечне Сергей Зверев и помощница мэра Грозного Нурседа Хабусеева. Мэр Грозного Супьян Мочхаев получил ранение в голову.
31 мая 2000 г. — в городе Волгограде, в Дзержинском районе, в непосредственной близости от КПП 255-го мотострелкового полка 20-й Гвардейской дивизии прогремел взрыв. Двое солдат убиты и 15 тяжело ранены.
12 июня 2000 г. — муфтий Ахмат Кадыров назначен главой администрации Чеченской республики.
14 июня — Ахмад Кадыров выступает с заявлением, в котором призывает боевиков "прекратить сопротивление, сложить оружие и вернуться к мирной жизни".
8 августа 2000 г. — взрыв в Москве в переходе под Пушкинской площадью. В результате взрыва погибли 13 человек (семь скончались на месте и еще шестеро в больнице), 118 человек, в том числе шестеро детей, получили различные ранения.
12 октября — крупный теракт в Грозном у здания Октябрьского РОВД. В момент, когда туда подъезжала машина с сотрудниками прокуратуры, был взорван автомобиль УАЗ-469, начиненный взрывчаткой. Погибли 10 человек, ранены 16.
5 февраля 2001 г. — в Москве на станции метро "Белорусская-кольцевая" произошел взрыв. В общей сложности в результате взрыва пострадали 15 человек. В основном пострадавшие получили контузии и ожоги.
24 июня 2001 г. — убит полевой командир Арби Бараев.
24 сентября — в Чечне задержан Адам Умаров, глава вооруженной группировки, входящей в состав отряда, возглавляемого полевым командиром Русланом Гелаевым.
1 ноября 2001 года — в Чечне убит один из самых известных духовных лидеров мусульман Магомет Долкаев.
5 декабря 2001 года — Салман Радуев признан Верховным судом Дагестана виновным по всем статьям обвинения: нападение на Кизляр, незаконное лишение свободы людей, захват в плен пензенских омоновцев, похищение оружия, организация незаконных вооруженных формирований.
17 января 2002 года — минувшей ночью в Чечне уничтожен полевой командир по кличке «Узбек», который был "третьим лицом" в окружении арабского военного, воевавшего в Чечне — Хаттаба.
9 мая 2002 г. — теракт в Каспийске. Взрывное устройство сработало на обочине дороги при прохождении праздничной колонны. Погибли 45 человек, более 170 ранены.
19 августа 2002 года — в Чечне убит полевой командир Мусанна.
10 октября. — в Грозном взорвано здание Заводского РОВД. Погибли 25 человек.
19 октября — у ресторана «Макдоналдс» на улице Покрышкина (Юго-Западный АО) сработало взрывное устройство, заложенное в автомобиль «Таврия». Восемь человек получили ранения, один из пострадавших впоследствии скончался в больнице.
23 октября 2002 года — отряд чеченских террористов-смертников во главе с Басаевым захватил Театральный Центр на Дубровке в Москве, в котором находились около тысячи зрителей и актеров мюзикла «Норд-Ост». Главным требованием террористов был вывод войск с территории Чечни. 26 октября в результате спецоперации по освобождению заложников (в зал через вентиляционные шахты был запущен нервно-паралитический газ) были уничтожены и все боевики, и часть заложников — 129 человек.
28 декабря 2002 года — взрыв Дома правительства Чечни. Погибли 70 человек и около 200 были ранены.
23 марта 2003 года — референдум в Чечне по вопросам о поддержке проекта новой Конституции Чечни, законов о выборах Президента и Парламента республики. По данным избиркома получены невероятные результаты. За проект Конституции Чеченской республики проголосовали 95,97 % участников референдума. За закон о выборах президента Чечни высказались 95,4 % избирателей. А закон о выборах в парламент поддержали 96,05 %.
12 мая 2003 года — в чеченском селении Знаменское у зданий администрации Надтеречного района и УФСБ РФ взорван начиненный взрывчаткой «Камаз». Погибли 60 человек, более 200 ранены.
5 июля 2003 года — теракт на московском аэродроме в Тушино, где проходил рок-фестиваль «Крылья». Погибли 16 человек, 57 получили ранения.
1 августа 2003 г. — в Северной Осетии взорвано здание Моздокского госпиталя. Погибли 50 человек, более 60 ранены.
5 декабря 2003 г. — в Ставропольском крае взорван поезд "Кисловодск—Ессентуки". Погибли 44 человека, 156 ранены.
9 декабря 2003 года — в Москве у гостиницы «Националь» две смертницы привели в действие взрывное устройство. Погибли 6 человек.
6 февраля 2004 г. — взрыв в поезде на перегоне между станциями «Автозаводская» и «Павелецкая» Московского метрополитена. Погибли 40 человек, более 10 получили ранения.
9 мая 2004 г. — во время праздничного концерта на стадионе «Динамо» в Грозном был взорван президент Чечни Ахмад Кадыров.
21 июня 2004 г. — чеченские диверсанты предприняли масштабное нападение на Ингушетию. Были атакованы здания МВД и СИЗО, а также штаб Назранского погранотряда, совершено нападение на Карабулак, станицы Слепцовская и Орджоникидзевская. Всего подверглись атакам около двух десятков административных сооружений и военных объектов. Погибли 88 человек, большая часть из которых сотрудники милиции и ФСБ, 117 человек получили ранения.