Собственно штурм начался только рано утром 1 сентября. К этому времени орудия были установлены на прямую наводку — так что одни из двух городских ворот очень быстро оказались разбитыми. Красноармейцы рванулись внутрь — однако площадь за воротами оказалась обложена тюками хлопка, облитыми керосином. Отступая от ворот, бухарцы их подожгли. Прорвавшись сквозь огонь, красные тут же втянулись в долгий уличный бой. Все же к ночи город был взят, за исключением цитадели. Ее штурм красные оставили на утро.
Однако утром выяснилось, что воевать уже не с кем. Цитадель никто не защищал. Ночью большинство защитников разбежалось, а эмир удрал с тысячей своих нукеров. Красным осталось только зачистить город от некоторого количества фанатиков, собиравшихся умереть во имя Аллаха.
Так что Фрунзе мог с чистой совестью отправить Ленину телеграмму:
«Крепость Старая Бухара взята сегодня штурмом соединенными усилиями красных бухарских и наших частей. Пал последний оплот бухарского мракобесия и черносотенства. Над Регистаном победно развевается красное знамя мировой революции».
14 сентября были образованы Всебухарский революционный комитет, Совет народных назиров (комиссаров). 8 октября того же года Бухара стала столицей Бухарской народной советской республики (БНСР).
Но все оказалось не так просто. В очередной раз подтвердилась истина, что взятие столицы не обязательно означает конец войны.
1-я армия под командованием Г. В. Зиновьева гонялась за эмиром и поддержавшими его басмачами весь остаток года. Да и на следующий год пришлось идти в горную часть эмирата — только 2 февраля красные взяли Душанбе и вытеснили Алим-хана и его сторонников в Афганистан. Эмир Афганистана, имевший мирный договор с РСФСР, но и не желавший выдавать «брата», держал его в качестве почетного пленника, ежегодно выделяя средства на содержание.
Эмир с тех пор так и жил к Кабуле, где умер в 1943 году. Примечательна судьба его сыновей. После бегства отца они остались на советской территории. Двое были убиты в стычках с красными, а третий, Шахмурад, в 1929 году отрёкся от отца. Приняв фамилию Олимов, он служил в Красной Армии, а в 1960-х годах преподавал в Военной академии имени Фрунзе.
Но и на этом дело не закончилось. Красные не до конца осознали местную специфику. Пока крупные войска присутствовали — в окрестностях было все спокойно. Когда уходили — начиналось веселье. Главной трудностью была близость Афганистана — даже если оставить за скобками, что афганский эмир неявно сочувствовал басмачам. Прочной власти в удаленных районах Афганистана не было никогда, так что басмачи могли держать свои базы за границей и воевать сколько угодно.
Тем временем в руководстве БНСР начались неизбежные трения. Младо-бухарцам социализм был совершенно не нужен, да и курс на интеграцию в Туркестанскую советскую республику — тоже. Еще одной бедой стал хаос в подчиненности советских войск. Существовали части Красной Армии РСФСР, которые подчинялись командованию Туркестанского фронта. Были части Красной Армии БНСР, подчинявшиеся Старой Бухаре. Имелась еще народная милиция (не в современном понимании, а в изначальном — вооруженные жители). Эти подчинялись местным властям. Бардак-с…
А вот у противников Советской власти появился очень серьезный лидер — Исмаил Энвер, в Средней Азии более известный как Энвер-паша. Это был деятель отнюдь не местечкового уровня…
По рождению и по национальности Исмаил Энвер являлся турком. Мало того — генералом Османской империи. Энвер-паша был идеологом так называемого пантюркизма — объединения всех тюркских народов на языковой и религиозной основе.
Еще в 1913 году Энвер организовал в Турции так называемую «Младотурецкую революцию» — первую попытку модернизировать дряхлую Османскую империю. Во время войны он занимал высший военный пост заместителя главнокомандующего турецкими войсками — то есть реально командовал именно Энвер, потому как главнокомандующим числился султан, не отличавшийся военными талантами.
Энвер-пашу обвиняют также в организации геноцида армян и греков во время Первой мировой войны. По крайней мере, трибуналом Антанты в Стамбуле он был заочно приговорен к смертной казни. Заочно — потому что вовремя успел убежать в Германию на немецкой подводной лодке.
В Германии он связался с деятелями из Коминтерна, через которых вышел на Советское правительство и пытался вести переговоры с большевиками о создании просоветского исламского движения и антибританского сопротивления на Востоке. Однако договориться не удалось. Москва сделала ставку на другого турецкого борца с британским империализмом — Мустафу Кемаля (Ататюрка). Тот являлся сторонником светской модернизации страны, без всяких религиозных закидонов. Большевикам это было ближе. И, что самое главное — Кемаль был в Турции и «на коне», а не в эмиграции…
Осенью 1921 года Энвер-паша оказался на Конференции Народов Востока в Баку. Там его чуть не пристрелили. Неизвестно кто — то ли дашнаки, то ли турки, сторонники Кемаля.
Тогда Энвер-Паша перебрался в Бухару. Действовал он хитро. Для начала — находился там в качестве гостя БНСР. Среди руководителей он, видимо, нашел тех, кому Советская власть не слишком нравилась. Одновременно вел переговоры и с представителями бывшего правительства эмира, получив от него звание «Главнокомандующего Вооруженными силами ислама и наместника эмира Бухарского».
Планов-то было громадье. Энвер вынашивал идею Пантюркистского Эмирата от Китая до Ирака, включая Бухару, Хиву, Афганистан, Персию. Раз уж в родной Турции не получиось…
Но переговоры с антисоветскими лидерами БНСР не удались. Тогда Энвер-паша пошел другим путем. Он оказался в Восточной Бухаре, где начал сколачивать боевые формирования, наладил взаимодействие с курбаши Ферганы и Хивы. Близость Афганистана позволяла без труда получать из-за кордона оружие и снаряжение.
Росту популярности Энвер-паши способствовало то, что он был зятем турецкого султана. Номинально султан являлся Халифом — то есть главой всех мусульман. В более-менее просвещенной Турции на это плевать хотели, но в среднеазиатской глухомани к таким делам относились серьезнее. На личной печати Энвера-паши была выгравирована надпись: «Верховный Главнокомандующий войсками Ислама, зять Халифа и наместник Магомета».
Пообщавшийся с коммунистами и кое-чего от них набравшийся, Энвер-паша выдвинул лозунг:
«Мусульмане всех стран, объединяйтесь!»
Ход был неплохой. Дело в том, что курбаши не могли договориться друг с другом не только из-за личных амбиций, но и по причине национальной розни. К примеру, узбеки и туркмены друг друга издавна терпеть не могли. А тут появляется такой вот, весь в белом, не принадлежащий ни к одной из местных национальностей…
…К концу 1921 года у Энвера-паши было около 20 тысяч человек. С этими силами он двинулся на Душанбе и после двухмесячной осады вынудил гарнизон сдать город. Фактически он теперь контролировал всю Восточную Бухару и уже начал поход на столицу республики.
Только тогда большевики поняли, что дело серьезно. В апреле 1922 года был организован специальный Басмаческий фронт, которому переподчинили все разнообразные военные и ополченческие части Красной Армии на территории БНСР. Это переломило ситуацию. Сыграла также роль и обычная у басмачей вражда между авторитетами. Другому уважаемому курбаши, Ибрагим-беку, очень не нравился невесть откуда взявшийся турок. Пока Энвер побеждал, Ибрагим-бек ему подчинялся. Но когда зятя султана начали бить, он предпочел отколоться.