Днем 11 декабря, когда бои уже практически закончились, авиация Черноморского флота нанесла очередной удар по Камыш-Буруну. Две шестерки Илов, несмотря на ограниченно летную погоду, противодействие истребителей и зенитной артиллерии, добились прямого попадания ФАБ-100 в баржу F559. Бомба прошла через надстройку и взорвалась в трюме. БДБ приняла очень много воды и выбросилась на берег. Сначала немцы посчитали ее полностью потерянной, но потом подняли и отбуксировали на ремонт в Одессу. Однако до самозатопления в августе 1944 в строй эта БДБ, видимо, не вступила.
11 декабря штаб 3-й группы высадки был расформирован, а Керченская база выведена из оперативного подчинения Холостякову и оперативно подчинена командующему АВФ. Керченско-Эльтигенская операция закончилась.
По данным штаба Отдельной Приморской армии, потери в ходе Керченско-Эльтигенской операции составили [116] :
| 1 ноября — 4 декабря 1943 г.* | 4 декабря | Всего | |||||||||
| СКФ | ОПА | ||||||||||
| 56 А | 18 А | 11 гв. СК | 16 СК | 20 CК | Итого | 11 гв. СК | 16 СК | 20 CК | Итого | ||
| Убито | 1295 | 900 | 330 | 583 | 196 | 3304 | 441 | 915 | 69 | 1425 | 4729 |
| Утонуло | 607 | 595 | 0 | 0 | 0 | 1202 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1202 |
| Пропало без вести | 0 | 177 | 16 | 0 | 13 | 206 | 26 | 3 | 2650 | 2679 | 2885 |
| Ранено | 4732 | 1551 | 1337 | 1477 | 322 | 9419 | 1845 | 2219 | 89 | 4153 | 13 572 |
| Итого боевые потери | 6634 | 3223 | 1683 | 2060 | 531 | 14 131 | 2312 | 3137 | 2808 | 8257 | 22 388 |
| Выбыло в госпиталь по болезни | 1340 | 452 | 217 | 420 | 0 | 2429 | 218 | 222 | 153 | 593 | 3022 |
| ВСЕГО | 7974 | 3675 | 1900 | 2480 | 531 | 16 560 | 2530 | 3359 | 2961 | 8850 | 25 410 |
* Видимо, по 3 декабря.
Потери до переформирования СКФ в ОПА (20 ноября) показаны с разбивкой на 18-ю и 56-ю армии, далее — по ОПА с разбивкой по корпусам. По 20-му корпусу потери включают Эльтигенскую группу и сражавшуюся на Еникальском плацдарме 83-ю омсбр. Потери частей усиления учтены в составе объединений и соединений, которым они были приданы.
Суммарные данные регулярной отчетности по потерям соединений и частей («форма 8») дают несколько большую величину — около 27 100 человек. Учитывая некоторую неполноту этих данных (в основном, по спецчастям), можно предполагать, что сумма потерь по форме 8 доходит до 27,5 тысячи человек. Возможно, расхождение вызвано разницей в учете соединений и частей, непосредственно не участвовавших в операции и убывших после 10 ноября с 18-й армией или остававшихся все время в глубоком тылу (например, 20-я гсд оставалась в районе Туапсе).