Скорее всего, между представителями грузинских властей и бандглаварями была достигнута неформальная договоренность о временном оставлении террористами самого Панкисского ущелья и их перемещении в горную местность, непосредственно примыкающую к грузино-российской границе. Их показания и полученные документы полностью подтверждают версию о том, что грузинские правоохранительные органы и силовые ведомства абсолютно никакое силовое воздействие в ходе проведения «антикриминальной операции» на отряд Гелаева не оказывали.
Остающиеся в блокаде разрозненные бандгруппы 28 сентября неоднократно пытались установить связь с абонентом из Саудовской Аравии. Средствами радиослежения федеральных сил было зафиксировано несколько соединений через спутник, после чего по координатам источника сигнала нанесли огневое поражение.
По словам Игоря Гиоргадзе, за десять дней до ее начала некий сотрудник спецслужб Грузии предупредил Гелаева о возможной операции, назвал ее сроки. В результате была достигнута договоренность об отводе боевиков в безопасное место. Так и произошло. Шеварднадзе, поймав какого-то нелегального араба, объявил, что операция прошла успешно. Президент побоялся подставить Гелаева и его людей. Почему? Они могли дать показания о провокации в Кодорском ущелье и причастности к ней Тбилиси.
Бывший министр МВД Грузии Каха Тамрмагадзе утверждал, что во время своего пребывания в министерском кресле спас Грузию от войны с Россией. «Появление в Панкисском ущелье отряда Гелаева вызвало большой резонанс в России и отношения между правительствами Грузии и России были серьезно напряжены… Тогда я поехал в Москву и провел серьезные переговоры по этому вопросу на разных уровнях. В результате огромных усилий удалось избежать грузино-российской войны в связи с чем, позже, меня объявили предателем».
По данным российской разведки, не так давно в Тбилиси состоялась встреча чеченских «авторитетных представителей» Панкиси из числа местных жителей сел Дуиси, Джокло, Халацани и чеченских боевиков с территории Чеченской Республики с руководящими сотрудниками спецслужб Республики Грузия. Последние поставили задачу по организации беспорядков на национальной почве в осетинских поселениях Панкиси с целью недопущения поддержки панкисскими осетинами «южноосетинских сепаратистов» в период проведения Грузией силовой акции в Южной Осетии.
Взамен чеченцам пообещали лояльное отношение к ним со стороны Тбилиси, разрешение проживания чеченских боевиков в некоторых районах Тбилиси и пригороде, а при условии успешной смены власти в Южной Осетии произвести полное переселение осетин из Панкисского ущелья. Чеченцам также было обещано не препятствовать их коммерческой деятельности. При этом им дали понять, что они не должны вторгаться в сферу деловых интересов «авторитетных лиц Грузии».
Эмиссары «панкисских чеченцев» приняли поставленные условия, обещали не заниматься наркоторговлей, похищением людей, избегать конфликтов с представителями власти Грузии. Представители боевиков Чечни поинтересовались возможностью в последующем развить продвижение в Кодорское ущелье. «Об этом мы говорить пока не будем, — заявили грузины, — но повод для дальнейших переговоров имеется».
В 2005 году, по указанию Саакашвили бывший министр обороны Грузии И. Окруашвили проводил несколько консультаций с представителями чеченских боевиков, входивших в группировку Р. Гелаева и братьев Ахмадовых. Грузинским руководством было обещано боевикам по 3–5 тыс. долларов за работу на Тбилиси. Им также были выданы грузинские паспорта на вымышленные грузинские, армянские, азербайджанские и курдские фамилии. Сейчас боевики рассредоточены по населенным пунктам Ахметского, Каврельского и Лагодехского районов. Кроме того, в Тбилиси решили не препятствовать боевикам в их перемещениях по всей территории Грузии. Они компактно расселяются и в пригороде Тбилиси (район Вашлисджвари) по фальшивым грузинским документам и в любой момент могут на личном автотранспорте и маршрутных такси выехать на задание грузинского руководства, а также, если потребуется, в Панкисское ущелье Грузии, а оттуда в сопровождении опытных проводников — в Россию, для пополнения рядов незаконных чеченских бандформирований.
В свою очередь, грузинские спецслужбы обвиняли Россию в активизации своих спецслужб в Панкисском ущелье. Руководитель разведки Грузии утверждал, что знает имена нескольких десятков жителей Панкиси и чеченских беженцев, которые активно сотрудничают с российской разведкой. Тогдашний директор Федеральной пограничной службы РФ Константин Тоцкий заявил на встрече с президентом Владимиром Путиным, что грузинская сторона знала о готовящемся переходе бандформирований из Грузии на территорию России. При этом генерал сослался на оперативные данные, а также на информацию, которую передал пограничникам грузинский чабан Телидзе.
В то же время, руководители Грузии неоднократно призывал к проведению в Абхазии «широкомасштабной операции по принуждению к миру» по примеру Боснии. Однако собственных возможностей для осуществления подобных операций у Грузии пока нет, а попытки использовать для этих целей российский миротворческий контингент путем расширения его мандата не имели успеха.
В свою очередь Грузия неоднократно делала предложения Украине и Турции ввести вместо MC РФ свои воинские контингента в зону конфликта. Но у абхазской стороны есть сомнения в соблюдении этими странами принципа нейтральности и беспристрастности. Можно предположить, что для вытеснения MC РФ и их дискредитации, грузинское руководство основную ставку делает на террор и диверсии. Однако Абхазия вовсе не собирается сдаваться. В Сухуми четко означили свою позицию: никаких международных сил на территорию республики ее руководство не допустит. В случае ухода российских миротворцев на их место встанут абхазские военные.
В то же время Грузия не теряла надежду вернуть Абхазию и Осетию силовым путем. С октября-ноября 2005 года стали реально воплощаться заявления политического руководства Грузии о возобновлении «партизанского» движения, акций диверсионного и террористического характера. Так, 25 июля 2006 подразделения грузинских вооруженных сил и МВД (до 1,5 тыс. человек) были введены в Кодорское ущелье, составляющее более трети Абхазии, для проведения спецоперации против местных вооруженных сванских формирований («ополчения», или батальона «Монадире») Эмзара Квициани, отказавшегося подчиниться требованию министра обороны Грузии Окруашвили сложить оружие. Квициани был обвинен в «измене родине» и сотрудничестве с абхазскими и российскими спецслужбами. Более того, 27 сентября 2006, в День памяти и скорби, указом президента Грузии Саакашвили Кодори был переименован в Верхнюю Абхазию. В феврале 2006 года Председателем правительства Абхазии в изгнании был утвержден Малхаз Акишбая.
В селе Чхалта на территории ущелья размещено так называемое «законное правительство Абхазии» в изгнании. В нескольких километрах от этого села дислоцированы абхазские военные формирования, подконтрольные Сухуми.
В преддверии вооруженного вторжения в Абхазию грузинские спецслужбы активизировали свою деятельность. Так, в сентябре 2007 года грузинские спецназовцы в Ткварчельском районе Абхазии напали на абхазский погранпост, в результате двое абхазских пограничников убиты, двое ранены, а еще семь человек пленены грузинскими спецслужбами. Грузинские спецслужбы силой выбили у захваченных в плен абхазских пограничников показание, что они планировали взрыв дороги в Кодорском ущелье. В результате грузинская версия выглядела следующим образом, абхазская диверсионная группа напала на охрану строящейся автодороги к Кодорскому ущелью, в перестрелке двое нападавших были убиты, семь задержаны. Грузинские СМИ также добавили, что взрыв якобы планировалось приурочить ко Дню независимости Абхазии. По версии абхазской стороны, бойцы спецподразделений Грузии атаковали учебный лагерь погранвойск в горах.