По мнению отечественного африканиста В.А. Попова: «многопартийность, парламентаризм и другие атрибуты буржуазного общества оказались прикрытием трибализма, а сам он по существу представляет собой не что иное, как использование элементов традиционной потестарной культуры в борьбе за власть» [8] .
Показательно, что референдум 1961 г. по проекту конституции, утверждающей построение централизованного унитарного государства, получил почти стопроцентную поддержку на юге и собрал менее 50% голосов на севере. В том же 1961 г. группа офицеров-северян в Харгейсе попыталась поднять восстание, которое, впрочем, не нашло тогда поддержки.
Но быстро набиравшая силу идея «Великого Сомали», в которое должны войти все территории проживания сомалийцев, на время отодвинула на второй план противоречия между севером и югом страны. Правительство Шермарка провозгласило право на самоопределение с последующим отделением и присоединением к Сомали для эфиопской территории Огаден, для кенийского Северного пограничного округа (СПО), для Французской территории афаров и исса. В эфиопском Огадене с 1961 г. начали действовать сомалийские повстанцы. В Северном пограничном округе Кении с 1963 по 1967 г. местный сомалийский Фронт освобождения СПО вел при поддержке Могадишо партизанскую войну.
Пансомалийская идеология привела к резкой милитаризации страны. Правительство хотело создать 10-тысячную боеспособную армию, однако не нашло поддержки на Западе [9] . Страна была создана из двух колоний и потому оказалась вне сферы постколониальной ответственности одной определенной страны. К тому же Западу не нравилась идея «Великого Сомали». США, союзник эфиопского императора Хайле Селассие, отказывались поддержать требования сомалийского руководства по Огадену Размеры запрашиваемой помощи казались чрезмерным. Италия, США и ФРГ предложили кредит в 10 млн. долларов, чего хватало на армию в 5-6 тысяч [10] . В 1962 г. Советский Союз согласился предоставить Сомали кредит в 35 млн. долларов для модернизации армии и увеличения её до 10 тысяч человек [11] . С 1964 по 1977 гг. в Сомали побывали почти четыре тысячи советских военных специалистов, в том числе 12 генералов [12] . В страну поставлялась советская военная техника. Более 800 сомалийских офицеров разного ранга прошли впоследствии обучение в военных вузах СССР [13] .
В руководстве страны продолжали доминировать представители клана маджертин/дарод. Министры-северяне из исаак в 1962 г., выйдя в отставку, сформировали вместе с кланами хавийя оппозиционный Сомалийский национальный конгресс. В 1964 г. президент Осман после парламентских выборов, на которых победила СМЛ, назначил премьер-министром вместо Шермарка члена СМЛ Абдиразака Хаджи Хусейна, который впервые сформировал правительство, основываясь на профессиональных качествах его членов, а не на их клановой принадлежности. Парламент отверг этот кабинет и согласился со вторым вариантом, где в большинстве своем снова были представлен клан маджертин и его союзники по СМЛ.
На президентских выборах 1967 г. победил Абдирашид Али Шермарк (маджертин). Он назначил премьер-министром Мохаммеда Ибрахима Эгаля (исаак). Пансомалийская риторика на правительственном уровне была смягчена, что несколько улучшило отношения с соседними странами. Перед парламентскими выборами 1969 г. правительство опубликовало указ, согласно которому в выборах могут участвовать независимые кандидаты. Число мест, полученных СМЛ и их союзниками, достигло рекордной отметки — 120 из 123 [14] . Теперь правительство и парламент, созданные СМЛ, фактически управлялись кланом маджертин/дарод при поддержке родственных кланов дарод. Однако межклановую борьбу в государственных органах это не остановило. Британский антрополог A.M. Льюис так охарактеризовал правительство, сформированное СМЛ: «разношерстная группа с расходящимися личными и клановыми интересами» [15] .
Как видно, уже в первые годы существования независимого сомалийского государства клановые противоречия приобрели острый характер, перейдя из социальной плоскости в политическую. Если поначалу делались попытки при формировании политических партий преодолеть проблемы трибализма, то вскоре традиционное противостояние и взаимное недоверие привело к созданию фактически клановых политических организаций. Размежевание шло по нескольким направлениям. Северяне (Сомалиленд) против южан (Итальянское Сомали), «кочевые» кланы против «земледельческих».
И исполнительная, и законодательная власть оказались под контролем клана маджертин, что лишь подпитывало межклановый антагонизм. Другие кланы справедливо считали себя обделенными. В то же время существовал и политически объединяющий фактор — пансомалийская идеология и сопутствующая ей милитаризация страны. Но именно этот фактор на фоне все обостряющейся борьбы кланов за власть способствовал приходу к власти военного диктатора Сиада Барре, а затем к войне с Эфиопией за Огаден, поражение в которой стало точкой отсчета процесса, приведшего в итоге к распаду сомалийского государства.
15 октября 1969 г. президент Шермарк был убит одним из своих телохранителей. Многие сомалийские политики, разочарованные многолетним правлением СМЛ, видели выход в том, чтобы прекратить засилие во властных структурах представителей кланов дарод и, прежде всего, маджертин. Например, в том, чтобы пост президента занял премьер-министр Эгаль (исаак). Сам же премьер-министр снова предложил на пост президента политика из маджертин/дарод — Мусу Бокора. Генерал Мо-хаммед Фарах Айдид позже утверждал, что Эгаль сделал это исключительно в обмен на поддержку дарод на будущих выборах [16] .
Высшие армейские офицеры пришли к выводу, что гражданские больше не способны контролировать ситуацию. 21 октября 1969 г. в столице страны Могадишо произошел военный переворот. К власти пришла военная хунта — Высший революционный совет, который возглавил начальник штаба вооруженных сил Сомалийской Республики генерал-майор Мохаммед Сиад Барре. Национальная ассамблея была распущена, действие конституции приостановлено, прежнее руководство страны арестовано.