В Оше с ранней весны 1990 года активизируются неформальное узбекское объединение «Адолат» и киргизская общественная организация «Ош-аймагы», которая ставила задачу обеспечения людей земельными участками для строительства домов.
Требования были в очередной раз озвучены на митинге, который состоялся в Оше 27 мая. Фактически, его участники поставили властям ультиматум. Прибывшие на митинг руководители области под напором согласились выделить небольшие участки земли под застройку, однако собравшихся это не устроило. Они потребовали, чтобы им передали 32 гектара хлопковых полей колхоза имени Ленина, в котором работали, в основном, узбеки. И это требование государственные чиновники удовлетворили. Участники митинга отпраздновали победу традиционной церемонией, зарезав лошадь и пообещав не уступать «завоеванной земли».
В узбекской общине это решение восприняли как оскорбление. Узбеки собрали собственный митинг, на котором также выдвинули требования властям: создание узбекской автономии и предоставление узбекскому языку государственного статуса. Вдобавок те из узбеков, кто сдавал киргизам жилье в Оше, стали массово избавляться от квартирантов. Это только способствовало разжиганию конфликта, тем более что выселенные из квартир люди (а таких, по некоторым данным, оказалось более 1,5 тысячи) также присоединились к требованиям передать участки под застройку.
31 мая власти признали, что решение о передаче упомянутых 32 гектаров колхозных земель было незаконным. Однако на развитие ситуации это повлиять уже не могло: с обеих сторон проходили многочисленные митинги — только 4 июня в них участвовали около 1,5 тысячи киргизов и более 10 тысяч узбеков.
Противостоявшие митинги разделяла только редкая цепь сотрудников милиции, вооруженных автоматами. Из толпы их стали забрасывать камнями и бутылками, были попытки прорвать оцепление. В итоге сотрудники милиции открыли огонь на поражение, были убиты 6 человек.
Разозленные толпы двинулись разными путями в город, поджигая машины и избивая представителей «враждебной» национальности, попавшихся на пути. Группа из нескольких десятков человек напала на здание Ошского ГОВД. Тут милиция, снова применив оружие, нападение отбила.
Гораздо более ожесточенный характер приняли столкновения в Узгене — районном центре, который также являлся местом компактного проживания узбеков. С утра 5 июня там начались массовые драки между киргизами и узбеками, причем перевес был на стороне последних. За несколько часов сотни киргизов были избиты, представители киргизской общины стали покидать город. Однако в Узген к тому времени уже стягивалось подкрепление: сотни, а затем и тысячи киргизов прибыли, чтобы «отомстить за соплеменников».
Уже к полудню в город стали прибывать организованные вооруженные группы киргизов из близлежащих сел. Именно они явились организаторами и участниками многочисленных погромов, поджогов, грабежей и убийств.
Резню удалось остановить лишь к вечеру 6 июня, введя в область армейские части. Ценой огромных усилий армии и милиции удалось избежать вовлечения населения Узбекистана в конфликт на территории Киргизской ССР. Поход вооруженных узбеков из городов Наманган и Андижан в Ош был остановлен в нескольких десятках километрах от города. Толпа сметала милицейские кордоны и сжигала автомобили, зафиксированы случаи столкновений с армейскими подразделениями. Тогда перед рвущимися в Киргизию узбеками выступили главные политические и религиозные деятели Узбекской ССР, что помогло избежать дальнейших жертв.
Всего в ходе столкновений в Ошской области, по официальным данным, погибло около 300 человек. По неофициальной информации, жертв было гораздо больше — до 10 тысяч.
Вновь межэтнические столкновения между киргизами и узбеками вспыхнули в городе Ош 10–13 июня 2010 года, став серьезным испытанием для новой киргизской власти.
Давние противоречия между узбеками и киргизами в очередной раз обострились в результате образования политического вакуума, вызванного государственным переворотом 2005 года.
О причинах конфликта существует несколько мнений. Представители временного правительства считают, что за беспорядками стоит провокация сторонников свергнутого в ходе апрельского восстания 2010 года президента Курманбека Бакиева.
В то же время есть версия, что вспышка насилия носила криминальный характер и возникла после убийства Айбека Мирсидикова по прозвищу «Черный Айбек», который контролировал узбекскую диаспору в городе и был связан с наркотрафиком и «семьей Бакиева».
Есть и серьезные разночтения событий, ставших началом «второй ошской резни», как практически сразу, причем даже на официальном уровне, назвали произошедшее в те дни. В первую очередь, появились слухи об изнасиловании и убийстве узбеками нескольких студенток в общежитии Ошского госуниверситета. По другой версии, в ночь с 10 на 11 июня узбеки на дискотеке убили киргизов. По третьей — драка между узбеками и киргизами началась возле городской мечети.
Хронология событий, восстановленная по многим источникам, такова.
11.06.2010.Беспорядки вспыхнули вблизи гостиницы «Алай» и городского рынка. Одними из первых были подожжены Узбекский драматический театр, здание телекомпании «ОшТВ», два кафе: «Меркурий» и «Альфаи», торговый центр «Мукарам» (тут стоит заметить, что торговля в городе принадлежала бизнесменам-узбекам).
Для поддержания порядка в город были введены части правительственной армии при поддержке бронетехники и вертолетов. Впрочем, вскоре часть бронетранспортеров была захвачена восставшими и широко использовалась в ходе погромов.
Горящий Ош, июнь 2010. Фото с сайта http://doseng.org
Под охраной армии началась эвакуация приезжих женщин из студенческих общежитий. На домах появились многочисленные надписи на киргизском — «Озбектерге олум» («Смерть узбекам!») или «Алга Кыргызстан!» («Вперед, Кыргызстан!»), «Мекеним Кыргызстаным!» («Родина Кыргызстан!»). На въездах в город были установлены блок-посты, чтобы воспрепятствовать прибытию агрессивно настроенной молодежи из окрестных сел. В городе зафиксированы первые случаи мародерства.
В это же время в Бишкеке молодежь киргизской национальности начала захватывать микроавтобусы и машины, чтобы ехать на юг для участия в столкновениях с узбеками. Несколько десятков человек ворвались в здание Гостелерадиокомпании и потребовали предоставить им прямой эфир.
12.06.2010.Беспорядки перекинулись на Джалал-Абад, где был подожжен Киргизско-Узбекский университет им. К. Батырова. Как показали дальнейшие события, уже на тот момент временное правительство по-прежнему было не способно справиться с волной насилия. Прекрасно отдавая себе отчет, Роза Отунбаева запросила помощь России, одновременно для спасения узбекских беженцев открыта граница с Узбекистаном. Из сообщений СМИ стало известно, что погромщики хорошо организованы, у них черные повязки на руках, машины без номеров, оружие, палки и арматура.