Эти перевозки охраняли также корабли Черноморского флота. 31 августа – 8 сентября 1993 г. сторожевой корабль «Пытливый» обеспечивал с моря эвакуацию грузинской техники из Сухуми.
В связи с блокадой Поти звиадистами для сторонников Шеварднадзе возросла роль Батумского порта. 2 сентября в Батуми прибыли два американских корабля, доставившие 60 тысяч тонн зерна в качестве гуманитарного груза. Вскоре в Батуми прибыли суда с 80 тысячами тонн зерна. Правда, до разблокирования железной дороги перевозка зерна в центральную Грузию была невозможна.
К концу августа Грузия, выполняя Сочинские соглашения, вывела с территории Абхазии до 12 тысяч личного состава и до 200 единиц бронетехники и артиллерийских орудий. В вывозе техники морем по взаимной договоренности использовался, помимо грузинских кораблей, один большой десантный корабль Черноморского флота. При этом абхазская сторона утверждала, что вывозится неисправная и поврежденная в боях боевая техника, а также автомобили. Одновременно сообщалось, что абхазская сторона выполнила все пункты Сочинского соглашения, а грузинская постоянно нарушала план и график вывода войск и вооружений с территории Абхазии, при этом отказываясь предоставить данные о численности бронетехники и различных вооружений.
В Сухуми, в Гульрипшском и Очамчирском районах была укрыта значительная часть военной техники, предназначенной к эвакуации, а солдаты и офицеры переодеты в гражданскую одежду и под видом местных грузинских жителей размещены в городе и в близлежащих районах. Абхазская сторона всю ответственность за возможные последствия возложила на Тбилиси.
В конце августа сторонники свергнутого президента Звиада Гамсахурдия заняли ряд населенных пунктов в западной Грузии. В ночь с 14 на 15 сентября они начали новое наступление против грузинских правительственных войск и блокировали железную дорогу Батуми – Тбилиси. В столице Грузии началась паника. Ходили слухи, что звиадисты вот-вот возьмут города Зестафони, Вани и взорвут Сурайский туннель, который связывает восточную и западную части Грузии. 16 сентября Шеварднадзе отдал приказ о начале боевых действий против звиадистов. Нестабильной ситуацией в Грузии в полной мере воспользовались абхазы.
16 сентября началась последняя наступательная операция абхазской армии, имевшая целью освобождения Сухуми. План ее держался в строжайшей тайне, и о нем знали лишь три человека: Главнокомандующий В. Ардзинба, министр обороны С. Сосналиев и бывший тогда начальником Генштаба Вооруженных Сил РА С. Дбар. Последний рассказал: «В принципе мы добились внезапности наступления. Эта операция отличалась от предыдущих. Если раньше, определив направление главного удара, мы сразу же выводили на передний план технику группировки, то сейчас до наступления на линию соприкосновения выводили только командиров бригад, и задача, которая ставилась перед ними, была конкретной, без раскрытия общего замысла наступления. После этого каждый командир вместе с теми, кто возглавлял отдельные подразделения, должен был изучить обстановку в глубину, по заданному ему направлению. И артиллерия выводилась на огневые позиции только с началом наступления.
Атака началась без предварительной, как бывает в таких случаях, артиллерийской и авиационной подготовки. Просто каждое подразделение выходило на свое место и бесшумно убирало наблюдательные посты».
ВМС Абхазии предписывалось входить в акваторию Сухуми и блокировать грузинские морские коммуникации только с началом боевых действий. Время начала наступления также было выбрано после внимательного изучения привычек и поведения противника – вторая половина дня, когда после обеда многие командиры и солдаты уходили в город и возвращались только ночью. Поэтому «час Ч» был назначен на 15 часов 30 минут 16 сентября.
Наступление было спланировано по всему фронту – на 40 километров в ширину и до 120 км в глубину – до Ингури. Была также поставлена задача блокирования автодороги и железнодорожного моста через Кодор, чтобы грузинская сторона не подтянула резервные силы и вооружения в Сухуми. С интервалом в один день эта масштабная операция развернулась по Очамчирскому (16 сентября) и Гумистинскому (17 сентября) фронтам, и 17 же сентября была успешно форсирована Гумиста.
В 5 часов утра 16 сентября ткварчельские отряды двинулись к побережью, захватили участок объездной дороги у села Цагера, заняли Тамыш, Старые Киндги, Аракич и большую часть трассы, приняли с моря две баржи с оружием и боеприпасами. Грузинская военная группировка в Абхазии была вновь разрезана на две части. Несколько часов спустя гудаутцы атаковали Сухуми и перешли Гумисту в районе Нижнего моста.
Таково было начало основной операции по взятию Сухуми, окруженного с трех сторон: Гумисты, моря и гор. Лишь промедление на Очамчирском фронте не позволило полностью замкнуть кольцо, однако исход операции уже не вызывал сомнений. 20 сентября абхазское командование предложило грузинским войскам покинуть Сухуми по коридору безопасности, однако ответа не последовало, и 21 сентября в городе начались уличные бои, продолжавшиеся почти целую неделю. В ходе ожесточенных боев за Сухуми пятитысячной Абхазской армии противостояли более 20 тысяч грузинских гвардейцев.
Министр обороны РФ Павел Грачев на встрече 17 сентября предложил Эдуарду Шеварднадзе ввести в столицу Абхазии Псковскую и Тульскую дивизии ВДВ и разъединить противоборствующие стороны, но тот отказался от этого спасительного предложения. 27 сентября Второй армейский корпус грузинской армии был разбит, а государственный флаг Республики Абхазия поднят над зданием Верховного Совета.
Абхазские ВМС, блокировав с моря Сухуми в 1993 г., сыграли важную роль при штурме города. ВМС командовал Юрий Ачба, начальником штаба ВМС был дагестанец Али Алиев, вице-президент КНК от лакского народа. В ночь на 16 сентября абхазская сторона дважды провела демонстрацию высадки морского десанта на пляж в центре Сухуми. После этих отвлекающих маневров основные силы Абхазской армии перешли в решительное наступление на Сухуми со стратегически важных высот, взятых под контроль в июле, и буквально обрушились на город.
После неудавшихся попыток в ночь на 19 сентября высадить морские десанты в районе Очамчира и Бабушера (у Сухумского аэропорта) в Гульрипшском районе к берегу подошли абхазские корабли с установками «Град» на борту и открыли огонь по Бабушере. Доставка подкреплений в Сухуми была возможна только воздушным путем, так как наземные пути были заблокированы отрядами абхазского Восточного фронта, вышедшими к Очамчире, а морские – контролировались абхазским флотом. Для перевозки войск грузинское командование задействовало гражданские авиалайнеры.
Помимо обстрела территории аэропорта, абхазские катера, вооруженные системами ПВО (ПЗРК «Стрела-2» и «Игла»), совместно с подразделениями ПВО и артиллеристами практически парализовали работу аэропорта Бабушера. Всего было сбито четыре самолета, а один поврежден.
Из этих самолетов два-три были сбиты расчетами ПВО. 20 сентября в 18 ч. 37 мин. стрелком-зенитчиком Атарского батальона Артуром Тарба был сбит Ту-154 (бортовой № 369931), перевозивший свыше ста грузинских солдат. 23 сентября над Тависуплебой (Верхняя Яштхуа) во время налета были обстреляны расчетом ПВО Гумистинского фронта (командир расчета Б. Ардзинба, пуск произвел В. Моисеев) два грузинских Су-25. Первый из них упал в 10 ч. 45 мин. в районе Абжаквы, при этом погиб командующий ВВС Грузии Цирцвадзе, второй предположительно упал, не долетев до аэродрома, но грузинская сторона отрицает потерю второго Су-25. Еще один самолет, Ту-134 (бортовой № 65001), был подбит на стоянке Сухумского аэропорта 23 сентября реактивной системой БМ-21 «Град» из села Одиша Сухумского района (командир расчета Нури Отырба, командир взвода Астамур Хашиг). Еще два самолета были сбиты с катеров.