В 1860 г. после передачи района Ниццы Франции Наполеон III подтвердил права нашего Морского ведомства на владение этим зданием и территорией. В тюрьме и примыкающих зданиях размещались «сенявинские» казармы, лазарет, склады и мастерские. В 1886 г. там была основана русская зоологическая станция.
В 1864 г. великий князь Александр Александрович в связи с кончиной его брата Николая посетил Вилла-Франко. Придворный историк С.С. Татищев писал: «В Генуе на вокзале встретили Цесаревича (Александра Александровича) в полной парадной форме контр-адмирал Лесовский и командиры трех судов его эскадры: фрегата "Александр Невский", корвета "Витязь" и клипера "Алмаз". Фрегат "Олег" остался в Вилла-Франке. Цесаревич очень обрадовался свиданию с ними и пригласил их обедать к себе в гостиницу. Обед прошел очень оживленно. Моряки рассказывали о впечатлениях, вынесенных из Соединенных Штатов, порты которых посетила эскадра Лесовского. Тут же было решено, что Наследник отправится в Ниццу на флагманском судне "Александр Невский"».
К 1879 г. «Русский дом» в Вилла-Франко был заброшен и находился под охраной одного служителя. Тем не менее Морское ведомство, не желая терять столь важный в стратегическом отношении пункт базирования кораблей, ежегодно выделяло на его содержание 1700 франков.
В 1884 г. приват-доцент Киевского университета А.А. Коротнеев вместе с русским зоологом М.Ю. Погтенполем обратился в Морское ведомство с просьбой передать «никому не нужное, кроме смотрителя, здание» для создания в нем русской зоологической станции на Средиземном море. Расходы по обустройству станции и ее содержанию Коротнеев брал на себя.
Весной 1886 г. Морское ведомство выделило Коротнееву три комнаты в «Русском доме». Там разместились кабинет директора, библиотека и лаборатория. На станции велись работы по сравнительной зоологии, изучению жизни моря и проводились практикумы для русских студентов. Финансировали станцию русские научные общества и лично Коротнеев. Также Морским ведомством и Министерством народного просвещения выплачивалась субсидия в 1000 рублей. С лета 1898 г. великий князь Михаил Александрович и великая княжна Ольга Александровна взяли станцию под свое августейшее покровительство.
В связи с этим Морское ведомство передало Коротнееву весь «Русский дом» и ассигнуемую на его содержание субсидию в 1700 руб. под «нравственную гарантию, что означенное имущество пойдет на устройство станции». Здание и земля передавались станции безвозмездно «на правах пользования», при сохранении всех юридических прав собственности за русским флотом. (Сх.7)
С высочайшего соизволения Морское ведомство и Министерство народного просвещения выделило средства на поддержку зоологической станции — 26 тыс. рублей на устройство и обзаведение и 7200 рублей ежегодно.
В 1906 г. у станции оказалась даже своя парусно-моторная яхта «Велелла». Особо Морское ведомство считало необходимым иметь на Средиземном море «нейтральное судно», которое при необходимости могло привлекаться для обслуживания русских стационеров.
Официально яхта была заказана в 1897 г. савойским принцем А. Видом, который «любезно обещал выделять ее для проведения зоологических экскурсий».
Яхту проектировал инженер К.П. Боклевский, в то время исполнявший во Франции обязанности «наблюдающего по кораблестроительной части», где строились броненосец «Цесаревич» и крейсер «Баян». Общий же контроль за постройкой всех русских кораблей, в том числе и яхты «Велелла», осуществлял капитан 2-го ранга И.К. Григорович, будущий морской министр. Уже одно это говорило о военном значении строившегося судна.
«Велелла» строилась в 1898—1899 гг. в Цюризе фирмой «Gescher-Wyss & С°». В начале 1900 г. яхта по железной дороге была перевезена в Геную, а затем на буксире парохода переведена в порт Санта-Маргарита. Там в поместье А. Вида ее окончательно снарядили и испытали. 30 апреля яхта своим ходом перешла в Вилла-Франко.
Но в исследовательских работах «Велелла» участия почти не принимала, и в первых отчетах станции упоминания о ней не встречаются. Это объясняется тем, что до 1903 г. яхта находилась в Тулоне в распоряжении «наблюдавших за постройкой».
«Велелла» имела существенный недостаток — слишком тихий ход. Установить на ней более мощные двигатели не удалось, и в 1906 г. теперь уже морской министр Григорович для зоологической станции «счел возможным разрешить приобретение специально приспособленного судна».
Яхта «Велелла» имела водоизмещение 13 т и была оснащена вспомогательным керосиновым двигателем мощностью 6 л. с, позволявшим развивать скорость до 5 узлов. Причем керосин для нее завозили прямо из России.
Сотрудничество Морского ведомства и станции продолжалось до 1914 г. Затем станция перешла в ведение исключительно Министерства народного просвещения. Однако право собственности сохранялось за Морским ведомством.
После революции 1917 г. централизованное финансирование станции прекратилось, и она существовала на субсидии Пражского, Варшавского и Белградского университетов, оставаясь в собственности России. В 1924 г., после признания Францией СССР и отказа советского правительства платить царские долги, французское правительство секвестрировало станцию и все ее имущество и передало ее Министерству общественного просвещения.
В ноябре 1932 г. декретом президента станция была окончательно передана в собственность Парижского университета, где она и находится по сей день.
В 1952 г. в НАТО вступили Турция и Греция. В ответ советское правительство пыталось найти пункты базирования нашего флота на Средиземном море. С союзницей Югославией Сталин быстро поссорился. Оставалась маленькая Албания.
28 мая 1954 г. из Севастополя вышел отряд кораблей Черноморского флота в составе крейсера «Адмирал Нахимов» и двух эсминцев пр. 30бис — «Буйный» и «Беспокойный» — под командованием командующего ЧФ адмирала С.Г. Горшкова с официальным визитом в Народную Республику Албания.
По пути в проливе Босфор катера под флагом США опасно маневрировали в 10—20 м от борта «Нахимова». В албанском порту Дуррес наши корабли пробыли 5 дней.
На обратном пути на «Адмирале Нахимове» шли премьер-министр Албании Энвер Ходжа и член правительства министр обороны Бекир Балука. На одном эсминце находилась известная албанская актриса, влюбившаяся в одного из курсантов ВВМИУ им. Ф.Э. Дзержинского. Они решили пожениться.
А тем временем адмирал С.Г. Горшков повел наши корабли к греческому острову Крит и проследовал вдоль его берегов. С флагманского крейсера последовала команда вести радиотехническую разведку, а штурманам и гидрографам — тщательно изучать район. В Севастополь отряд вернулся 6 июня.
В ноябре 1957 г. командующий Черноморским флотом адмирал В.А. Касатонов предоставил начальнику Главного штаба ВМФ адмиралу В.А. Фокину свои предложения об использовании Албании для базирования сил флота в Средиземном море. Он предложил базировать во Влёрском заливе — в бухте Паша-Лиман — бригаду подводных лодок из 10—12 единиц, часть из которых позже передать албанскому флоту. Для обороны баз предполагалось передать албанцам четыре дивизиона противокорабельных самолетов-снарядов [74] «Стрела». Вход в бухту Паша-Лиман закрыть боносетевыми заграждениями. Для охраны базы иметь дивизион противолодочных кораблей и противолодочные вертолеты.