Для задержания иностранных судов корабли ВМС Ирана угрожали применить оружие, даже если судно находилось в терводах Омана, в пределах которых располагалась система разделения движения судов, пользовавшихся правом транзитного прохода через Ормузский пролив. Так, кувейтское судно «Аль-Ваттия» было остановлено в оманских терводах, отконвоировано в порт Бендер-Аббас, разгружено там, а груз конфискован.
В 1986 г. иранские корабли продолжали досмотры судов в Ормузском проливе. Только в январе—феврале они задержали и досмотрели около 600 иностранных судов, выявив при этом 11 судов с грузом для Ирака, который и был конфискован.
К концу 1986 г. иранцы перешли от угроз применения оружия к его применению против невооруженных торговых судов. По ночам фрегаты типа «Саам» обстреливали иностранные суда у побережья ОАЭ и Омана в Ормузском проливе, Для доразведки цели, наблюдение за которой начиналось еще в Оманском заливе силами и средствами, привлекаемыми для контроля за судоходством, с корабля по радио уточнялись национальная принадлежность судна, характер груза и порт назначения. После этого судно обстреливалось корабельной артиллерией и противокорабельными ракетами «Си Киллер». Так, 17 октября в 5 милях от оманского берега ракета «Си Киллер» поразила следовавший в Кувейт гонконгский танкер «Файв Брукс», а в ноябре иранские ракеты попали в судно «Огест Стар» и цементовоз «Шаам».
С 1986 г. в «танкерной войне» начали принимать участие и ВМС Корпуса стражей исламской революции (КСИР), организационно оформленного весной 1987 г. Для решения боевых задач на море морское крыло Корпуса было укомплектовано быстроходными катерами малого водоизмещения (около 100 катеров), сведенными в бригады, которые базировались в Бендер-Аббасе и Бушире. Передовыми пунктами базирования катеров были острова Абу-Муса, Томбе-Бозорг и Сирри в зоне 1-го военно-морского района, остров Фарси и захваченный у Ирака полуостров Фао в зоне 2-го военно-морского района, а также разбросанные по всему Персидскому заливу иранские искусственные сооружения нефтедобычи.
Катера ВМС КСИР были вооружены стрелковым и тяжелым пехотным оружием как стационарного типа, так и носимым, в основном противотанковым. Как показал последующий ход боевых действий, это оружие оказалось вполне пригодно для использования в специфических условиях войны в Персидском заливе. Также на катерах устанавливались специально изготовленные направляющие реактивных систем залпового огня типа БМ-13 — «Миникатюши», как их окрестили иранцы. Катера вооружались и 106-мм безоткатными орудиями, противотанковыми гранатометами РПГ-7, противотанковыми управляемыми ракетами «ТОУ» американского производства, американскими же зенитно-ракетными комплексами «Стингер», поступавшими в Иран от афганских муджахидов.
С мая 1987 г. катера КСИР стали использоваться для нарушения морских перевозок южнее и юго-восточнее острова Абу-Муса и западнее и северо-западнее острова Фарси. Катера выходили в море по ночам, что обеспечивало им скрытность и внезапность нападений, поскольку обнаружить такие быстроходные и малоразмерные цели с помощью РЛС было достаточно сложно.
6 мая катера КСИР атаковали в северной части Персидского залива советский сухогруз «Иван Коротеев».
В марте 1987 г. командование КСИР Ирана в целях усиления контроля над стратегически важным Ормузским проливом, в северную часть которого с 1986 г. были перемешены основные нефтеэкспортные операции страны, развернуло на островах Кешм, Хенгам, Хормоз и северо-восточном побережье пролива противокорабельные ракетные комплексы «Силкуорм» китайского производства — всего 12 пусковых установок с боекомплектом 40 ракет. Эти комплексы были созданы в Китае на базе советских ПКР П-15 и обладали мощной боевой частью. Такие же комплексы были размещены на полуострове Фао для поражения морских целей в северной части Персидского залива и береговых объектов в Кувейте. Боевые расчеты ракетных комплексов были сведены в два дивизиона — «Сулейман 26» и «Асиф Фао 36».
Осенью 1987 г. ракеты комплекса «Силкуорм» были применены против торговых судов и береговых объектов. Так, 3 сентября запущенная с полуострова Фао ракета «Силкуорм» упала в двух милях от кувейтского нефтяного комплекса. Через два дня двумя ракетами был нанесен удар по другим кувейтским объектам — порту Мин-Абдаллах и острову Файлака. 15 октября американский танкер под либерийским флагом был поражен иранской ракетой в порту Эш-Шуайба, а на следующий день кувейтский танкер «Си Айсл Сити» под американским флагом загорелся после попадания ракеты в 7 милях от порта Мин-эль-Ахмади.
В свою очередь иракские ВВС продолжали атаки иранских терминалов и транспортов с иранской нефтью. Для участия в рейдах привлекались многоцелевые истребители «Мираж» F-1, взлетавшие с минимальным запасом топлива и максимальной бомбовой нагрузкой. В ходе выполнения задачи они дважды дозаправлялись в воздухе. Наиболее успешными были два последних налета на суда терминала острова Ларк. 22 декабря 1987 г., используя авиабомбы с лазерной системой наведения, иракские самолеты поразили крупнейший в мире танкер «Сивайз Джайат» водоизмещением 564 739 т и танкер «Уорлд Петробраз» водоизмещением 411 508 т, шедшие под либерийскими флагами. В это же время авиабомбы поразили и нанесли повреждения британским танкерам «Бурман Энтерпрайз» и «Бритиш Респект». Однако возникшие в результате попадания бомб пожары были ликвидированы. Только на танкере «Уорлд Петробраз» пожар принял серьезный характер, но в течение девяти чесов нефть с него была откачена на другие танкеры.
14 мая 1988 г. иракские ВВС произвели еще один налет на нефтяной терминал в Ормузском проливе. Вновь пострадал «Сивайз Джайат», и на этот раз настолько серьезно, что танкер было решено не восстанавливать. На испанском танкере «Барселона» в результате взрыва авиабомбы погибло 17 человек. Получили повреждения и британский танкер «Бурман Энтерпрайз», кипрский танкер «Аргоси» и иранский танкер «Харк».
Налеты иракской авиации еще раз показали, что боевые части западных противокорабельных ракет, в том числе «Экзосет», недостаточны для поражения крупнотоннажных торговых судов. Однако возникшие в результате применения оружия пожары могли привести к потери судна. Поэтому для оказания помощи судовым расчетам по борьбе за живучесть руководство иранской судоходной компании привлекло несколько зафрахтованных судов-спасателей, которые включались в состав конвоев и постоянно находились в районах, подвергавшихся налетам.
Осенью 1987 г. иракская авиация попыталась уничтожить суда-спасатели, обеспечивавшие челночные рейсы танкеров в районе острова Харк. 13 октября иракская ракета поразила спасательное судно «Сальваторе», которое в момент нападения тушило пожар на танкере «Фортуна шип Л». Еще через несколько дней ракета «Экзосет» поразила другое спасательное судно «Салвива».
Многие танкеры были атакованы по несколько раз, но после ремонта они снова возвращались в строй. Иранский танкер «Дена» выдержал шесть ударов, кипрский танкер «Поликон» — пять, иранский танкер «Тебриз» — четыре; либерийский танкер «Медуза», кипрский «Сьюпиер», южнокорейский «Ройал Коломбо», мальтийский «Фри энтерпрайз» и иранский «Ширван» получили по три удара.
Иранские же атаки были еще менее результативными. Так, 9 июля 1987 г. либерийский танкер «Пеконик» дедвейтом 273 тыс. т в балластном рейсе получил повреждения от попадания 18 реактивных противотанковых гранат, но остался на плаву. Однако в декабре того же года иранские катера в Оманском заливе атаковали и подожгли зарегистрированный в Сингапуре танкер «Норман Атлантик» водоизмещением 85 129 т. Команда покинула судно, а спасательные буксиры не смогли приблизиться к полностью загруженному кувейтской нефтью танкеру, так как вокруг него горела разлившаяся нефть. Танкер выгорел полностью и затонул.