Конечно, военные народ дотошный и то, чем в действительности занимается «Оборонсервис», для многих стало ясно с первых же дней существования холдинга. Против подобных «реформ» выступили кадровые офицеры, как в Генштабе и самом министерстве, так и в войсках. С первых же дней поэтому «Маршал Табуреткин» последовательно подавлял «бунт на корабле», проводя расчистку кадров в центральном аппарате Минобороны и на местах. Прежде всего, Сердюков освободился от двух категорий руководителей. Первая — те военачальники, которые управляли серьезными финансовыми потоками, ведали закупками вооружения и распоряжались наиболее привлекательными объектами недвижимости и земельными площадями. Их квалификация, способность решать поставленные задачи при решении их судьбы в аппарате министра во внимание не принимались. Главное для Сердюкова при подборе своей команды — это личная преданность. «Чужим», в том числе доставшимся ему по наследству от Сергея Иванова, он не доверял и, к великому неудовольствию нового вице-премьера, поторопился от них избавиться. Так, начальником вновь сформированного Главного управления капитального строительства стал близкий к Сердюкову Леонид Сорокко, всего лишь за год до этого бывший гендиректором строительной фирмы в Санкт-Петербурге, а затем призванный в советники министра. Начальником Главного управления обустройства войск МО РФ был назначен еще один земляк и выдвиженец министра — Олег Коваль, до прихода в систему Минобороны работавший в городе на Неве коммерческим директором строительной фирмы. По похожему сценарию решилась судьба начальника связи Вооруженных сил. В ноябре 2007 года была учреждена совершенно новая для российского военного ведомства должность — заместителя министра обороны, отвечающего за развитие автоматизированных систем управления, информационных технологий и связи. Ее занял Дмитрий Чушкин, который до этого никакого отношения к армии не имел, зато работал вместе с Сердюковым в налоговой сначала Санкт-Петербурга, а затем и Москвы, и считался верным ему человеком. Ему же под финал «сердюковщины» в МО РФ вменили в обязанности исполнение Гособоронзаказа.
Одним из последних ставленников Сердюкова стал экссенатор Григорий Нагинский, который возглавил «Спецстрой России». Компания «Титан-2», созданная г-ном Нагинским, оказалась замешана в уголовных делах по «Оборонсервису». ОАО «Сосновоборэлектромонтаж», входящее в стройхолдинг «Титан-2», приобрело 29,9 % акций 31-го Государственного проектного института спецстроительства (ГПИСС), проектировавшего установки РВСН и объекты воздушно-космической обороны. Эпизод с продажей по сниженной цене акций этого института вошел в 2012 г. в одно из уголовных дел по военному ведомству.
Вторая категория уволенных — люди не просто не входившие в команду министра, но и открыто возражавшие против нововведений Сердюкова, как полного профана в военном деле. В этой категории, как уже говорилось, оказался начальник Генерального штаба генерал Балуевский, который «посмел» возражать «Маршалу Табуреткину». А начальника Службы расквартирования и обустройства войск Минобороны РФ генерал-полковника Виктора Власова и увольнять не нужно было. Он сам застрелился, не вынеся всего того, что творилось вокруг. По некоторым данным, это произошло спустя пару дней после разговора Власова с Сердюковым. Его предсмертная записка, в которой он объяснил причины своего самоубийства, бесследно исчезла.
Назначенный вместо Балуевского генерал Макаров, которому Сердюков отдал на откуп собственно военную часть реформы Вооруженных Сил, внимательно следил за теми, кто выражал хоть малейшее сомнение в правильности действий Сердюкова, которому новый начальник генштаба стремился всячески угодить. Жертвой Макарова пал его заместитель, начальник Главного оперативного управления Генштаба генерал-лейтенант Андрей Третьяк, выступивший против ничем не обоснованного, по его мнению, сокращения своего управления. Такая же участь ждала главнокомандующего ВМФ адмирала Владимира Высоцкого, посмевшего оспорить целесообразность перевода штаба флота из Москвы в Санкт-Петербург. Макаров известен и тем, что критиковал разработки российских танков, которые, по его мнению, не обеспечивали сохранность жизни военнослужащих, в отличие от зарубежных разработок, которые так прельщали «Маршала Табуреткина». Весной 2013 г. в ходе допроса в Следственном комитете Макаров признал, что в 2011 г. он руководил «военной частью» операции по строительству сердюковской «мызы» под Астраханью — базы отдыха «Житное».
Шойгу, сразу же после своего назначения министром уволил Макарова. Но уже 26 января 2013 года он был назначен… ведущим аналитиком управления генеральных инспекторов Министерства обороны РФ. Приказ об этом назначении Макарова подписывал не сам Шойгу, а статс-секретарь — заместитель министра обороны РФ Николай Панков. С Макаровым при Сердюкове они работали в паре.
В газете «The Moscow Post» была опубликовала серия статей о паркетном генерале Панкове, который по ее характеристике, сыграл «роль палача боевых офицеров, роль орудия их уничтожения по воле Сердюкова». Панков при Табуреткине был главным кадровиком, в его прямом подчинении был начальник Главного Управления кадров Минобороны Горемыкин. Вот они-то по указанию «Табуреткина» и уволили из армии таких боевых генералов, как Владимир Бакин, Александр Беспалов, Анатолий Хрулев, Владимир Булгаков, Владимир Свиридов. Генерал Сергей Юдин — один из самых заслуженных боевых офицеров чеченской кампании — был незаслуженно снят с должности командующего армии, с явной попыткой выдавить его из армии полностью. Был отстранен от должности, за прямоту и неподкупность, генерал Юрий Дашкин.
В апреле 2009 г. путинский официоз «Российская газета» опубликовала интервью с Панковым под восторженным аншлагом ««Под нож» решено пустить 117 тысяч офицерских постов». Панков в этом интервью всячески рекламировал «Рособоронсервис», одной «из задач которого станет трудоустройство военных отставников». Получилось, как раз наоборот. Уволеннных из армии офицеров туда принципиально не брали. Панков же, рекламируя творение Сердюкова, утверждал: «Новая структура возьмет на себя функции обеспечения армии всем необходимым. Туда войдут 19 субхолдингов, в том числе — строительный. Хотя замыкаться «Рособоронсервис» будет на военные ведомства, все должности в холдинге сдают гражданским». («Российская газета», 28.04.2009). Наворовать за время, прошедшее со дня публикации этого интервью до первых арестов в «Рособоронсервисе» успели действительно на миллиарды. Утверждения же Панкова о том, что массовые увольнения кадровых офицеров позволят России сильно сэкономить на военных расходах тоже оказались блефом. Военные специалисты подсчитали, что «сокращение личного состава российских вооруженных сил, осуществленное статс-секретарем Николаем Панковым обошлось государству в 1,65 трлн. рублей». Из чего складывается такая цифра? По распоряжению Панкова уволено 200 тысяч офицеров. Обучение одного офицера в военном ВУЗе в год стоит около 1 млн. рублей (летчики — еще дороже), срок обучения составляет 4 года. Таким образом, на подготовку одного офицера государство затрачивает примерно 4 млн. рублей. Сокращение 200 тысяч офицеров Панковым вылилось, следовательно, в 800 млрд. рублей, фактически впустую потраченных на их обучение в военных вузах. Но это не все. Примерно половина офицеров продолжили обучение в военных Академиях, где учеба обходится казне уже дороже — около 1,5 млн. рублей в год на слушателя или 4,5 млн. рублей за три года. Уволенные Панковым из армии офицеры, прошедшие подготовку в военных Академиях, стоили еще 450 млрд. рублей — опять-таки выброшенных на ветер государственных денег.