21 апреля Курманбек Бакиев, перебравшийся в Минск, отрёкся от своей отставки, объявив новую власть преступной. 21 апреля 2010 года в здании исполкома СНГ, расположенного в Минске (Белоруссия), президент Кыргызстана Курманбек Бакиев выступил с заявлением для прессы: «Мой народ переживает страшную трагедию. Банда самозванцев объявила себя властью и творит беспредел, убивает мирных людей, разрушает жилища. Грабёж и насилие стали нормой жизни. Страна отброшена на десятки лет назад. Я, как президент и как гарант Конституции Кыргызстана, не снимаю с себя ответственность за катастрофу, которую переживает мой народ, и готов ответить за это по закону. Но это не значит, что я могу подчиниться бандитам и бросить свой народ в беде. В этой связи я заявляю следующее. Первое. Я ещё раз выражаю глубокие соболезнования всем родственникам и близким погибших. Второе. Я не признаю свою отставку. Почему, объясню позже. Девять месяцев тому назад народ Кыргызстана избрал меня президентом, и я присягнул служить ему. Нет силы, которая заставит меня отказаться от моей клятвы. Только смерть остановит меня. Я, Курманбек Бакиев, законно избранный президент Кыргызстана, признанный мировым сообществом. Третье. Все должны знать, что бандиты, которые пытаются захватить власть, — исполнители чужой воли и не имеют никакой легитимности. Кыргызстан не будет ничьей колонией. Мой народ хочет быть свободным и станет свободным, продолжит строительство современного независимого демократического государства».
11 июня ожесточённые столкновения вспыхнули в городе Ош, в ходе которых было ранено более 2000 человек и ещё 828 были госпитализированы. В городе введён комендантский час, отключён газ, на улицах возведены баррикады и зафиксированы случаи мародёрства. Иностранные агентства сообщают об этнической подоплёке событий, поскольку в городе Ош компактно проживает узбекское меньшинство. В это же время в Бишкеке молодёжь киргизской национальности начала захватывать микроавтобусы и машины, чтобы ехать на юг для участия в столкновениях с узбеками. Некоторые из них ворвались в здание Гостелерадиокомпании и потребовали предоставить им прямой эфир.
12 июня, несмотря на принимаемые меры, беспорядки только усилились, перекинувшись на несколько других южных городов, в том числе и на Джалал-Абад, в котором имеются жертвы. Правительство приняло решение о частичной мобилизации, введении круглосуточного комендантского часа в охваченных беспорядками районах, разрешении милиции стрелять на поражение. Из-за пожаров, погромов и мародёрства город Ош сильно пострадал, были разрушены, разгромлены или сожжены 70 % домов. 400 000 беженцев устремились в соседний Узбекистан.
27 июня 2010 года в Киргизии прошёл референдум по новой конституции страны. Её одобрили 90,57 % проголосовавших. Киргизия стала парламентской республикой, в ней ликвидирован Конституционный суд, а глава временного правительства Роза Отунбаева стала президентом переходного периода до 31 декабря 2011 года. При этом она не будет иметь право занимать должность президента после окончания этого срока. На 10 октября 2010 года были назначены выборы в парламент. Референдум состоялся, несмотря на то, что многие в стране призывали его отложить в связи с происшедшим на юге Киргизии межнациональным конфликтом.
2 июля 2010 года Центризбирком прекратил полномочия депутатов прежнего парламента республики.
14 июля. Сформировано переходное техническое правительство Киргизии. По официальным данным, всего во время массовых беспорядков, которыми сопровождалась смена власти в Киргизии, погибло 84 человека. В общей сложности количество обратившихся за медицинской помощью превысило 1500 человек, более 500 человек госпитализировано. Сколько людей погибло от пуль военных, до сих пор неизвестно. Неизвестно также проводилась ли баллистическая экспертиза пуль, и хранятся ли эти пули в качестве вещественных доказательств.
8 апреля по приказу Президента России Дмитрия Медведева в Киргизию были направлены две роты российских десантников для защиты авиабазы Кант и семей российских военнослужащих.
По сообщению пресс-секретаря президента России Дмитрия Медведева ситуация в Киргизии свидетельствует о крайнем возмущении действующей властью со стороны народа. С критикой свергнутой власти выступил и премьер-министр России Владимир Путин. Чуть позднее Путин в разговоре с Розой Отунбаевой, возглавившей «правительство народного доверия Киргизии», объявил, что Россия готова оказать материальную помощь Киргизии ввиду «особого характера отношений» между странами.
Пресс-секретарь премьер-министра России Владимира Путина Дмитрий Песков 13 апреля сообщил, что Путин не встречался с Атамбаевым и никакой помощи ему не обещал. Разговор о помощи шёл, по словам Пескова, в телефонном разговоре Путина и Отунбаевой, но и там речь шла только о гуманитарной помощи, поскольку Путин, по словам Пескова, не поддерживает, ни одну из сторон конфликта.
Тем не менее, 14 апреля вице-премьер — министр финансов России Алексей Кудрин на совещании у премьер-министра России Владимира Путина сообщил, что Россия предоставляет Киргизии грант 20 миллионов долларов и льготный кредит 30 миллионов долларов по линии Россельхозбанка. В. Путин заявил на совещании правительства, что всё происходящее в Киргизии — «это внутреннее дело самой Киргизии», но ситуация в республике сейчас критическая, и при необходимости Россия увеличит объём помощи. Путин рассказал российскому правительству, сославшись на заявления руководства временного правительства Кыргызстана, что там «казна пустая», и что «прежнее руководство страны всё разворовало». «Это, конечно, не нам судить, — заметил В. Путин. — Но с учётом того, что у нас всегда были особые отношения с киргизским народом, в трудную для Кыргызстана минуту мы наших друзей в Кыргызстане поддержали». Путин поручил правительству и дальше поддерживать связь с временным правительством Кыргызстана, чтобы «оперативно принимать решения вместе с коллегами по поводу их потребностей».
Казахстан и Узбекистан закрыли свои государственные границы с Киргизией 8 апреля.
12 апреля посольство США в Кыргызстане распространило сообщение, в котором говорится, что утром 12 апреля посол США Татиана Гфэллэр встретилась с главой временного правительства Розой Отунбаевой, чтобы выразить свои соболезнования ей и всем гражданам Кыргызстана, потерявшим близких или пострадавшим во время событий последних дней. В сообщении было сказано: «Посол Гфэллэр и г-жа Отунбаева обсудили также вопросы, касающиеся предстоящего визита помощника Государственного секретаря США Роберта Блейка в Кыргызстан. Посол Гфэллэр ещё раз подтвердила готовность правительства США продолжать предоставлять Кыргызстану гуманитарную помощь и оказывать поддержку демократическому развитию страны». Было также заявлено, что «посольство США не имеет планов по предоставлению убежища г-ну Бакиеву или оказанию ему помощи в отъезде из Кыргызстана. Все сообщения с противоположным содержанием абсолютно не соответствуют действительности». 16 апреля было распространено заявление о продлении договора с США об аренде базы Манас ещё на год.
20 апреля 2010 года президент Белоруссии Лукашенко заявил, что не считает конституционным произошедший переворот и предоставляет убежище семье президента Бакиева, в составе его самого, его жены и двоих детей.