Прах сэра Генри недолго покоился в земле. 7 (17) июня 1692 года сильное землетрясение и вызванное им цунами разрушили Порт-Ройял. Часть города погрузилась на дно Карибского моря, включая кладбище, на котором был погребен бывший вожак флибустьеров.
Вдова сэра Генри, Мария Елизавета Морган, пережила его на восемь лет. Она умерла в Спаниш-Тауне и была похоронена в местной приходской церкви 3 (13) марта 1696 года.
Если бы имя Генри Моргана сохранилось лишь в архивных документах и сочинениях историков, его носитель вряд ли приобрел бы всемирную известность. Однако необычная биография «короля» флибустьеров, возведенного в рыцари и занявшего пост вице-губернатора Ямайки, со временем привлекла к себе внимание многих деятелей литературы и искусства. Благодаря им — писателям, поэтам, художникам, музыкантам и кинематографистам — Морган превратился в человека-легенду, интерес к которому не ослабевает и в наше время.
Широкую известность Генри Морган приобрел в XIX — первой половине XX века, когда его «подвиги» на Испанском Мей-не, описанные Эксквемелином, взялись романизировать европейские и американские писатели. Так, капитан Эдвард Хоуард написал исторический роман «Сэр Генри Морган, буканьер», опубликованный в 1842 году, уже после смерти автора, в двух томах. Помимо сочинения Эксквемелина Хоуард использовал также доступные ему документы, касавшиеся деятельности Моргана и его современников.
В 1869 году вышел в свет приключенческий роман мексиканского писателя Висенте Рива Паласио «Пираты Мексиканского залива», неоднократно издававшийся и на русском языке. Хотя Морган не является главным героем этого произведения, Рива Паласио сделал его одной из ключевых фигур двух «пиратских» частей романа.
Такое же почетное место Морган занял в романах итальянского писателя Эмилио Сальгари «Черный корсар» (1898) и «Иоланда, дочь Черного корсара» (1905).
В романе Джека Лондона «Сердца трех», написанном в соавторстве с Чарлзом Годдардом и впервые опубликованном в 1919–1920 годах в газете «Нью-Йорк джорнэл», молодой потомок «пирата Моргана», который оставил ему богатое наследство, отправляется в Центральную Америку на поиски сокровищ своего предка. Легенда о кладе Моргана возникла благодаря туманному замечанию Эксквемелина, что после грабежа Панамы, во время дележа добычи, адмирал предупредил флибустьеров о пропаже большого количества драгоценностей. Позже эту историю с пропажей части панамских сокровищ активно эксплуатировали в своих произведениях и другие авторы.
Некоторые выдающиеся деяния Генри Моргана легли в основу одного из лучших романов Рафаэля Сабатини «Одиссея капитана Блада» (1922). Наибольшее число заимствований из биографии Моргана можно обнаружить в главах XVI и XVII, посвященных захвату капитаном Бладом испанских городов Маракайбо и Гибралтар в Венесуэле, а также уничтожению им испанской эскадры адмирала дона Мигеля де Эспиноса-и-Вальдеса. В другом романе Сабатини, «Хроники капитана Блада» (1931), пираты ищут клад Моргана, якобы спрятанный им на Панамском перешейке. И еще раз Сабатини возвращается к образу Генри Моргана в романе «Черный лебедь» (1932). Его герой Шарль де Берни, ранее участвовавший в походах адмирала Моргана, берется выполнить опасное задание своего друга, теперь уже ямайского губернатора сэра Генри Моргана, по поимке пиратской шайки «пресловутого Тома Лича» и, естественно, блестяще справляется с ним.
Примечательно, что первый роман американского писателя Джона Стейнбека — «Чаша золота» — был посвящен жизнеописанию Генри Моргана. Прежде чем выйти в свет в августе 1929 года, роман был отвергнут семью издателями. Тем не менее весь дебютный тираж в 1500 экземпляров разошелся мгновенно — завистники говорили, что это произошло благодаря яркой обложке с изображением пирата, но оставим данное утверждение на совести тех, кто отнесся к первому незрелому опыту писателя критически. Скорее всего, успех «Чаши золота» был предопределен выбором главного героя.
Австралийский писатель Филипп Линдсей посвятил Моргану сразу два своих романа — «Морган на Ямайке» (1930) и «Панама в огне» (1932).
В 1949 году вниманию американских читателей был представлен роман историка и писателя Фрэнсиса Ван Вика Мейсона «Империя абордажной сабли» (в русском переводе — «Король абордажа»), написанный в классических традициях историко-приключенческого жанра. Подобно Стейнбеку, Мейсон не идеализировал своего героя, показав, как насилие, жестокость и кровь сопровождали Моргана на всем жизненном пути.
Во второй половине XX и начале XXI века количество романов и повестей, посвященных Моргану, резко возросло. Среди них наиболее заметными были произведения Элизабет Макинтош, писавшей под псевдонимами Джозефина Ти и Гордон Дэвиот («Приватир», 1952; в русском переводе — «Джентльмен удачи», 1998), Яна Флеминга («Живи и дай умереть», 1954), Леонарда Вибберли («Пещера мертвеца», 1954), Николаса Монсаррата («Шкипер-моряк», 1978. Кн. 1), Айзека Азимова («Мародер», 1993), Стивена Тэлти («Империя Синей Воды», 2007) и Ллойда Шеферда («Английский монстр», 2012).
Кинематограф тоже внес свою лепту в популяризацию образа Генри Моргана. В 1909–1910 годах во Франции последовательно вышли три серии фильма «Пират Морган», снятого режиссером Виктореном Ипполитом Жассе (в роли Моргана — актер Жан Мари Делиль).
В 1941 году американский режиссер Джордж Ваггнер снял фильм «Остров ужаса», в котором герои отправляются на экскурсию на остров, где спрятаны сокровища Генри Моргана, но неожиданно сталкиваются с жутким призраком-убийцей.
В следующем году на экраны вышел классический фильм о пиратах «Черный лебедь», снятый Генри Кингом по мотивам одноименного романа Сабатини. Роль губернатора Ямайки сэра Генри Моргана в картине сыграл актер Лейрд Крегер.
В фильме Рауля Уолша «Пират Черная Борода» (1952) Генри Морган (актер — Торин Тетчер) неожиданно выступает противником другого знаменитого пирата — Эдварда Тича, в действительности промышлявшего на морях в начале XVIII века.
В 1960 году был снят итальянский фильм «Пират Морган», главную роль в котором сыграл актер Стив Ривз, а год спустя на экраны вышел фильм американского режиссера Роберта Уэбба «Пираты Тортуги». Роль Моргана в нем досталась Роберту Стивенсу.
В 1976 году итальянский режиссер Серджио Соллима осуществил экранизацию романа Сальгари «Черный корсар»; в картину на роль капитана Моргана был приглашен актер Анджело Инфанти.
Эпизодически образ Моргана появлялся и в других фильмах о пиратах — например, в фильме Гора Вербински «Пираты Карибского моря: На краю света» (2007).
Поскольку в массовом сознании пираты Карибского моря обычно ассоциировались с ямайским ромом, компания «Сигрэм» в 1944 году придумала отличный маркетинговый ход и стала производить этот спиртной напиток под названием «Ромовая компания Капитан Морган». В 2001 году она продала бренд «Капитан Морган» британской компании «Дайеджио».
В последние годы интерес к деяниям Генри Моргана значительно оживился в связи с находками останков фрегатов «Джамайка мерчент» и «Сэтисфекшн». Так, в 2001 году немецкий подводный кладоискатель Клаус Кепплер сделал сенсационное заявление, что у берегов острова Ваш, к югу от Гаити, он обнаружил останки какого-то судна. Сначала кладоискатель предположил, что это — останки флагманского корабля Моргана «Оксфорд», затонувшего где-то в тех краях в январе 1669 года. Однако последующие исследования навели Кепплера на мысль, что, скорее всего, он наткнулся на останки судна «Джамайка мерчент», на котором Морган возвращался из Англии в качестве вице-губернатора.