После войны продолжил службу в ВВС ВМФ. Окончил командное отделение Высших офицерских курсов авиации ВМС (1947). Командир 4-й аэ (с 17.10.1947), начальник штаба 1-й зам. командира 78-го иап (с 06.04.1948), майор (13.01.1949), начальник ВСС 91-й иад ВВС СФ (с 15.12.1949), зам. командира, инспектор-летчик по технике пилотирования и теории полета 124-го гиап СФ (с 19.04.1951,) подполковник (22.12.1951). Военный летчик 2-го кл. (26.11.1952), 1-го кл. (27.03.1953). Окончил авиационный факультет BMA в г. Ленинграде (31.10.1956). Зам. начальника штаба ИА ПВО ЧФ (с 31.10.1956); пом. начальника штаба по КП ВВС ЧФ (с 18.10.1956); начальник оперативно-разведывательного отделения — зам. начальника штаба 4-й иад ВВС ЧФ (с 25.05.1957), полковник (28.02.1957).
Награжден орденами Ленина, пятью орденами Красного Знамени (19.01.1943, 02.10.1943, 10.04.1944, 30.04.1945, 1956), орденом Красной Звезды (1951), пятью медалями, в т. ч. «За боевые заслуги» (1946), «За оборону Ленинграда» (1943), знаком «Отличник ВМФ».
27.08.60 г. уволен в запас по служебному несоответствию, выразившемуся в совершении проступков, порочащих звание военнослужащего. 10.09.60 г. осужден за изнасилование несовершеннолетней. 19.01.1961 г. лишен звания Героя Советского Союза. В 1961 г. был освобожден, восстановлен в воинском звании. Жил в г. Саки.
В октябре 1942 г. группа молодых летчиков — выпускников Ейского ВМАУ была направлена в расположение командующего ВВС КБФ. Незадолго перед этим 3-й гиап, сражаясь на «харрикейнах», понес наибольшие за период войны потери, и большую часть пилотов распределили в этот полк. Алексей Баранов, Виктор Головко, Николай Мокшин, Александр Пархоменко, Александр Потемкин, Петр Прасолов, Николай Шестопалов, Юрий Шорин попали во 2-ю эскадрилью этого полка, которой командовал в то время Михаил Львов. В этой же группе находился и летчик-инструктор училища сержант Александр Шилков.
Новичков предстояло ввести в строй. Опытные летчики-асы полка Львов [123] , Каберов [124] , Татаренко [125] , Минаев [126] и Цапов [127] поочередно летали с каждым летчиком, проверяли их подготовку. Как вспоминал, в то время командир звена И. Цапов: «Держится за ведущим, не отстает — значит, можно брать в полет».
Боевая страда для летчиков полка наступила очень скоро.
12 января, в первый день наступления наших войск с целью прорыва блокады Ленинграда, авиация в воздух с утра не поднялась — погода была нелетной. В 11 часов состоялся митинг личного состава 3-го гиап в связи с полученным приказом о наступлении войск Ленинградского фронта. На митинге от имени молодых летчиков выступил Александр Шилков. Он заявил:
«У меня погиб брат, защищая Москву, второй брат погиб, защищая Сталинград, и вот клянусь вам, что я не пожалею сил и самой жизни на защиту города Ленина».
К полудню, несмотря на прескверную погоду, в воздух поднялась восьмерка ЛаГТ-3 второй эскадрильи. Группу повел комэска Львов. Ее состав был смешанным. Кроме комэск, до этого в боях побывали Татаренко и Щеголев. Для Лобко, Рябушкина, Потемкина, Шестопалова и Шилкова это был первый боевой вылет. Самолеты поднялись в воздух в 12.10 с задачей прикрыть наши войска в районе Марьино— Манушкино — Пески и не допустить бомбардировщиков противника на правобережье Невы.
Произошедший затем бой довольно красочно описал в своем очерке «Молодые истребители» писатель Н. Чуковский:
«ЛаГГ-3 шли над артиллерийскими вспышками, над ползущей в снегу пехотой. Воздух между землей и облаками был пустынен. Внезапно с земли передали по радио:
— Сзади два «мессеришитта». Истребители развернулись, но «мессеры» не приняли боя. Они пошли вверх и скрылись в облаках. «Лагги» пошли за ними. Пробив облака, справа, чуть повыше заметили ту же пару. Шилков оказался к ним ближе всех. Он развернулся на ведущего немца и пошел на него в лоб. «Мессер» вновь не принял боя. Он рванулся вниз, стараясь зайти под самолет Шилкова. Александр лег на «вверх колесами» и — за ним. Me-109 вновь нырнул в облака, Шилков — за ним. Увидев, что советский летчик не отстает, немец отвесно полез вверх и снова пробил облака.
Выскочив из облаков, Шилков оказался совсем близко от «мессера» и дал две очереди. Из самолета врага повалил дым, опустив левое крыло, он пошел вниз в облака.
Летчик Me-109 хитрил, почти коснувшись земли, он опять полез вверх. Шилков, который неотступно преследовал свою жертву, снова поймал его в прицел и дал по нему еще одну очередь. Левое крыло «мессера» совсем свисло, однако он все еще держался в воздухе и кружил под облаками на двухсотметровой высоте. Шилков поймал его на вираже и дал новую очередь. Пылая, Me-109 упал в лес, на северном берегу Невы, возле наших траншей. Шилков прошел над ним совсем низко. Красноармейцы махали нашему самолету руками, подкидывали в воздух шапки».
Нетрудно понять чувства, обуревавшие в этот момент пилота. Это был первый воздушный бой сержанта и первый сбитый им самолет противника. Этот самолет также открыл боевой счет мести летчиков-балтийцев в начавшихся боях по прорыву блокады Ленинграда! Победа окрыляет! Тем более победа в первом бою!
В официальном же рапорте о проведенном бое эмоции почти не видны. Из донесения гв. сержанта Шилкова:
«После 20-ти минут барража из облаков вышли два Me-109 и хотели атаковать снизу сзади. Разворотом «все вдруг» атаку отбили Me-109 ушли вверх за облака. Через 20–25 мин. в 12.40–12.45 было приказано с земли пробить облака и принять бой с Me-109. Станция наведения передала: «Справа сзади два истребителя противника». Мы развернулись и энергично пошли в лоб. Я отбил одного в сторону, зашел ему в хвост и начал преследовать его. Второго Me-109 атаковала оставшаяся группа. Me-109 сделал боевой разворот, я тоже, таким образом, мы очутились с ним на одной высоте. Ме-109 лобовую атаку не принял, а пошел вниз, я за ним и зашел ему в хвост. Он горкой ушел за облака, в конце горки я дал по нему очередь. Он задымил и пошел вниз со снижением по прямой. Я дал еще одну очередь, он еще больше задымил, потом резко дал горку, затем пошел со снижением на малой скорости. Добавил еще одну очередь, и он, горящий, врезался в лес в 3–4 км восточнее Манушкино. Я развернулся вправо и пошел с набором высоты, пристроился к Як-1 и над Ленинградом ушел от них, сел на аэродроме Капитилово, т. к. горючее было на исходе.