23 декабря 1986 г. в стране прошли очередные президентские выборы. Единственным кандидатом был Мохаммед Сиад Барре, набравший 99,93% голосов. Подобная формула проведения выборов вызвала резкую активизацию боевых действий оппозиционных сил. В январе 1987 г. боевики СНД атаковали армейскую базу Гумбурра в 20 км от Харгейсы. Погибли более сотни военнослужащих, в том числе командир базы [64] .
К этому моменту экономическая ситуация в стране достигла критической точки, что стало еще одной причиной будущей гражданской войны. В июне МВФ объявил о невозможности будущих кредитов для Сомали, ввиду многих лет непродуманной внутренней политики. В 1965-1987 годах финансовая помощь США составила 800 млн. долларов, Италия в 1981-1990 вложила в различные проекты более 1 млрд. долларов. Потребительские цены выросли с 1980 по1987на1000%. [65]
Вооруженная борьба кланов исаак стала примером для других кланов, недовольных положением вещей. Первые группы сопротивления кланов хавийя появились внутри СДФС в 1983 году Это были отряды клана хабр-гедир/хавийя. Но первая собственная «этническая» милиция была сформирована подкланом сад/хабр-гедир в 1988 году [66] . 1 февраля 1989 года в Риме хавийя официально зарегистрировали Объединенный сомалийский конгресс (ОСК).
Руководитель отделения ОСК в Могадишо Исмаил Джумале призвал генерала Мохаммеда Фараха Хасана Айдида, посла Сомали в Индии, присоединиться к ним. Айдид принял предложение и был избран председателем Конгресса [67] . Однако клановые противоречия предопределили будущий раскол ОСК условно на ОСК/Махди (глава — бизнесмен Али Махди Мохаммед) и ОСК/Айдид (глава — генерал Фарах Айдид). Первый контролировался кланом абгал при поддержке клана муросад. Второй контролировался кланом хабр-гедир при поддержке клана хавадле.
Сложившаяся ситуация оставляла мало пространства для маневра для Сиада Барре. Оппозиционные движения сформировались и набирали силу. Процесс становился необратимым. Приход к власти военных во главе генералом Барре в октябре 1969 года, по крайней мере на уровне деклараций, имел благую цель — прекратить хаос (по их мнению) гражданского правления, укрепить властную вертикаль, исключить клановые отношения из политического процесса. Полностью уничтожить клановую основу сомалийского общества задача не ставилась. С подобными целями на африканском континенте военные перевороты совершались не раз, однако достигались они лишь на короткий срок. Примерно то же произошло и в Сомали.
Борясь с трибализмом, Сиад Барре использовал его же методы, в итоге установив личную диктатуру через господство одной клановой группировки. С одной стороны, такая концентрация власти действительно прекратила всякую борьбу кланов в высших властных эшелонах и стабилизировала на какой-то период государственную систему. Но, с другой стороны, поддерживать стабильность такой системы возможно только с помощью репрессий против оппозиционных групп, неизбежно возникающих в конкурирующих кланах. В таких условиях достаточно только толчка, чтобы власть начала терять авторитет, а оппозиция, наоборот, набирать силу. Таким катализатором стало поражение Сомали в войне с Эфиопией за провинцию Огаден. С него начался закат правления Мохаммеда Сиада Барре и движение к разрушению сомалийского государства.
3 апреля 1988 г. на внеочередном саммите ИГАД делегации Сомали и Эфиопии подписали договор о ненападении и невмешательстве во внутренние дела. Менгисту Хайле Мариам и Мохаммед Сиад Барре обязались отказаться от поддержки размещенных на территориях их стран организаций эфиопских и сомалийских диссидентов. Сиад Барре официально прекратил всякую помощь боевикам Фронта освобождения Западного Сомали. Эфиопы, в свою очередь, закрыли тренировочные базы и лагеря СНД и СДФС. Движение СДФС было окончательно разгромлено, все его еще бывшие на свободе руководители были арестованы.
Последствия договора оказались в итоге катастрофическими для Барре. СНД, попав в безвыходное положение, просто вынуждено было перейти в наступление. Потеряв эфиопскую поддержку и понимая, что любое затягивание борьбы ведет теперь к гибели, руководство Сомалийского национального движения отказалось от тактики действия небольших боевых групп, решив встать на путь открытого вооруженного противостояния. Большую роль в этом сыграла демилитаризация эфиопо-сомалийской границы. В соответствии с пунктом № 4 договора о мире, Могадишо и Аддис-Абеба начали отвод войск от границы. Ослабление пограничного контроля дало возможность действовать более активно. Создав Объединенные силы освобождения, 27 мая 1988 г. повстанцы атаковали правительственные войска. Бурао был захвачен в первые дни боев. Началась сомалийская гражданская война.
Боевики СНД атаковали лагеря беженцев из Эфиопии Агабар и Лас Дуре, расположенные недалеко от Харгейсы, где находились сомалийцы клана огаден и других недружественных исаак кланов. 43 человека было убито, причем 13 из них повстанцы показательно казнили [68] . Эти и другие нападения СНД на лагеря беженцев заставили многих из них вступить в сомалийские вооруженные силы, а также в парамилитарные карательные части. Таким образом, антиправительственный мятеж начал превращаться в межклановую войну, в провоцировании которой, как видно, виноваты не только части, верные Сиаду Барре. Вскоре Барре объявил восстание на севере «мятежом племени исаак» против единства Сомали.
Армия, части МВД и спецслужбы широко применяли расстрелы и пытки. За время боев только за первые два месяца погибли до 10 тыс. человек [69] . С мая 1988 года по январь 1989 года в северо-восточные районы Эфиопии бежали от 300 до 500 тысяч сомалийцев [70] . Неучтенное количество беженцев приняли Кения, Джибути, а также южное и центральное Сомали. В итоге правительственным силам удалось отбить к середине августа 1989 г. все важнейшие стратегические пункты на севере, но контролировать север страны Сиад Барре уже не мог.
Отряды СНД в середине ноября после тяжелых боев захватили важнейший стратегический город Галькайо в 400км к северу от Могадишо. Решающим моментом в этом сражении стал переход на сторону повстанцев четырех полковников из командования гарнизона и еще 64 офицеров из различных частей, защищавших город, причем многие сдались вместе с подчиненными солдатами [71] .