Попытки ударной группы форсировать реку Белая 7,8 и 9 июня успеха не имели. Но 25-й дивизии В.И. Чапаева удалось переправиться на другой берег Белой и занять небольшой плацдарм в районе Красного Яра (18 километров северо-западнее Уфы). После этого в полосе чапаевской дивизии развернулись тяжелые бои. Здесь колчаковцы 9 июня силой пяти полков перешли в наступление, предприняв «психическую атаку». Об этом комиссар 25-й дивизии Д.А. Фурманов писал: «Черными колоннами, тихо- тихо, без человеческого голоса, без лязга оружия шли в наступление офицерские батальоны с Каппелевским полком. Они раскинулись по полю и охватывали разом огромную площадь. Была, видимо, мысль — молча подойти вплотную к измученным, сонным цепям и внезапным ударом переколоть, перестрелять, поднять панику, уничтожить…
Эта встреча была ужасна… Батальоны подступили вплотную, и разом, по команде, рявкнули десятки готовых пулеметов… Заработали, закосили… Положили ряды за рядами, уничтожили… Повскакали бойцы из окопов, маленьких ямок, рванулись вперед. Цепями лежали скошенные офицерские батальоны, мчались в панике каппелевцы — их преследовали несколько верст… Этот неожиданный успех окрылил полки самыми радужными надеждами».
После неудачного проведения контратак в ночь на 9 июня части Уфимской группы противника были вынуждены отойти в северовосточном направлении. Вечером 9 июня части 25-й стрелковой дивизии вступили в Уфу.
После этого начался третий этап операции, который продолжался с 10 по 19 июня. В эти дни ударная группа Туркестанской армии, преодолев упорное сопротивление Волжской группы противника, форсировала реку Белая и развила наступление на Архангельское, Урман.
Уфимская операция увенчалась победой, хотя и не полной с точки зрения поставленной задачи, так как окружить и уничтожить противостоящего противника не удалось, но все же победой очень крупной по своим последствиям. В результате удара, полученного на р. Белая, колчаковские части откатились к Уральскому хребту и были настолько ослаблены, что в дальнейшем 5-я армия одна справилась с форсированием Среднего Урала, занятием Златоуста и Челябинска.
Таким образом, Бугурусланская, Бугульминская и Белебеевская операции хотя и различались по ближайшим задачам и по направлениям главных ударов, представляли собой этапы одной и той же операции — контрнаступления советских войск против колчаковских армий к югу от Камы с целью их уничтожения. Цель эта не была осуществлена в полной мере, тем не менее были достигнуты хорошие результаты. За период с 28 апреля по 20 мая по направлению Самаро-Златоустовской железной дороги было с боями преодолено 220 километров. От противника удалось очистить Самарскую губернию с прилегающими к ней районами Уфимской и Казанской губерний. Потери в соединениях противника были более чем чувствительными. Из всей Западной армии генерала Ханжина боеспособность сохранила одна Самарская дивизия 1-го Волжского корпуса, а остальные практически потерли боеспособность. Огромный урон был нанесен моральному духу колчаковских войск. По показаниям свидетелей, многие бойцы белой армии при отходе из-под Бугульмы брели без винтовок, пьяные, разрозненными толпами, не слушаясь своих офицеров.
Представляют интерес записи, сделанные в дневнике генерал- лейтенантом бароном А. Будбергом. В 1915 году он возглавлял штаб 10-й армии, в 1917 году командовал Двинским корпусом, с марта 1919 года — главный начальник снабжения при Ставке Колчака, с мая — управляющий военным министерством. В них отражена обстановка весны — лета 1919 года, дана характеристика А.В. Колчака и его окружения.
«13 марта. Из Омска тянутся вереницы гастролеров, противно смотреть на эту публику, убегающую от работы под предлогом смотров, инструктирования и т. п… Адмирал уехал на фронт для поднятия настроения, как это старо и как пахнет очковтирательством… Позорно читать правительственные сообщения о поездках Верховного Правителя с славословиями о его мудрости…
30 апреля. Являлся Верховному Правителю… Вынес симпатичное впечатление: несомненно очень нервный, порывистый, но искренний человек, острые и неглупые глаза, в губах что-то горькое и странное, важности никакой, напротив — озабоченность, подавленность ответственностью, иногда бурный протест против происходящего.
1 мая. Вернулся с фронта начальник штаба Верховного генерал Лебедев… Что побудило адмирала взять себе в помощники случайного юнца? этого "вундеркинда"?.. Все горе в том, что у нас нет ни настоящего Главнокомандующего, ни настоящей Ставки, ни сколь-нибудь грамотных старших начальников. Адмирал ничего не понимает в сухопутном деле, легко поддается советам и уговорам, Лебедев безграмотный в военном деле, случайный выскочка, чересчур надут и категоричен.
7 мая. Еду в поезде Верховного Правителя в Екатеринбург. Адмирал мрачен и утомлен, молчит и только сверкает глазами… На вокзале Екатеринбурга были встречены командующим сибирской армией генералом Гайда… здоровый жеребец с двумя Георгиями, очень вульгарного типа… Трудно ожидать полководческих талантов и приличного понимания широкого военного дела от бывшего австрийского фельдшера и подчиненных ему тридцатилетних генералов… Пришлось увидеть, что руководство операциями находится в руках младенцев, очень дерзких и решительных, но смотрящих на дело со ступеньки ротного командира…
9 мая. Настроение мрачное… Скверно, что Верховный Правитель едва ли в состоянии сломать все это и навести порядок, очень уж он доверчив, легковерен, не сведущ в военном деле, податлив на приятные доклады…
…На Пасху поднесли адмиралу Георгия 3-й степени за освобождение Урала. Слабохарактерный адмирал не нашел в себе силы воли и широты взгляда приказать забыть о таких подношениях — и принял крест…
Жалко адмирала, когда ему приходится докладывать тяжелую и грозную правду, он то вспыхивает негодованием, гремит и требует действий, то сереет и тухнет, то закипает и грозит всех расстрелять, то никнет и жалуется на отсутствие дельных людей, честных помощников…
7 июня… После обеда был с очередным докладом у Адмирала. Тяжело смотреть на его бесхарактерность и отсутствие у него собственного мнения… Лучше бы он был самым жестоким диктатором, чем тем мечущимся в поисках за общим благом мечтателем, какой он есть на самом деле… Адмирал, по-видимому, очень далек от жизни… Между тем по всему чувствуешь, что этот человек остро и болезненно жаждет всего хорошего и готов на все, чтобы этому содействовать, но отсутствие знаний, критического восприятия и анализа не дают ему выбиться на настоящую дорогу… По внутренней сущности, по незнанию действительности и по слабости характера он очень напоминает покойного Императора…
Страшно становится за будущее, за исход той борьбы, ставкой в которой является спасение родины и вывод ее на новую дорогу… Поразительно, до чего в Омске повторяется в миниатюре Царское Село: та же слепота вверху, та же непроницаемая кругом стена, застилающая свет и правду, обделывающие свои делишки люди».
Командование Южной группой войск Восточного фронта стало очередной яркой страницей в военной биографии М.В. Фрунзе. Он не только выполнил сложную оперативную задачу, но и окреп как военачальник. Его имя стало хорошо известно многим советским руководителям, в том числе и лично В.И. Ленину. Это открывало новые перспективы.