Шесть дней и ночей черноморцы занимались эвакуацией беженцев из Сухуми, вывезя 13 781 человека (количество беженцев в разных публикациях различаются). В операции участвовали большие десантные корабли «Константин Ольшанский», «БДК-69», сторожевой корабль «Ладный», минный тральщик «Снайпер», спасательные суда «Эпрон» и «ГС-402» проекта 872, средний морской танкер «Свента» типа «Дубна». В сентябре—октябре 1993 г. поисково-спасательный корабль «ПСК-137» Черноморского флота обеспечивал ход эвакуации беженцев из Сухуми.
В первой половине октября корабли Черноморского флота, участвовавшие в эвакуации, вернулись в Севастополь. За участие в операции 24 наиболее отличившихся военных моряка были представлены к наградам.
27 сентября малый десантный корабль на воздушной подушке «МДК-93» проекта 1232.2 Черноморского флота доставил в район грузинского города Очамчира морской десант в составе разведгруппы отдельного разведбатальона морской пехоты Черноморского флота под командованием старшего лейтенанта А.В. Белявского. Морские десантники способствовали выводу из района боевых действий десантно-штурмовой роты российских миротворческих сил. Пятьдесят десантников ВДВ были эвакуированы с морского побережья и доставлены в район города Гудаута. Эвакуация проходила на фоне продолжавшихся боевых действий, обе стороны вели беспорядочный огонь, угрожавший безопасности десантников и морских пехотинцев. Во время эвакуации катер без опознавательных знаков четыре раза обстрелял «МДК-93». К счастью, обошлось без жертв среди моряков.
Для моральной поддержки грузинских войск и для собственного пиара в Сухуми в июне 1993 г. прибыл сам Эдуард Шеварднадзе. Оказавшись в окруженном городе, Шеварднадзе обратился за помощью к американскому президенту Клинтону. А тот, в свою очередь, попросил Ельцина спасти Эдуарда Амвросиевича. Если верить СМИ, в Сухуми Шеварднадзе побожился Ельцину, что Грузия вступит в СНГ.
По приказу Ельцина Черноморский флот обеспечил эвакуацию Шеварднадзе, войдя в прямое огневое соприкосновение с абхазской стороной. В операции был задействован «МДК-93». Подробности в декабре 1993 г. рассказал корреспондент «Красной звезды» Владимир Пасякин: «Черноморцам была поставлена задача эвакуировать из Сухуми главу грузинского государства на десантном корабле на воздушной подушке типа «Зубр». Обязанности командира на этом «летающем» корабле исполнял начштаба дивизиона капитан 3 ранга Сергей Кременчуцкий, старшим на борту был комбриг капитан 1 ранга Виктор Максимов. Однако в указанном месте и в указанный час «Зубр» дважды был встречен буквально шквалом огня. В то же время Шеварднадзе совсем другим путем покинул Сухуми. Была ли в этом случае утечка информации или же черноморцев специально подставили – время покажет».
Спустя семь лет ситуацию прояснил на страницах «Независимой газеты» (за 25 января 2000 г.) командующий береговыми войсками и морской пехотой Черноморского флота в 1987–1995 гг. генерал-майор Владимир Романенко: «В сентябре 1993 года Шеварднадзе отправился в Абхазию, решив на месте ознакомиться с ситуацией. Однако в результате активных действий абхазских вооруженных сил президент Грузии оказался блокирован на Сухумском аэродроме. Положение было критическим – аэродром был окружен со всех сторон «шилками», охрана Шеварднадзе из последних сил отбивала наступление абхазских вооруженных формирований.
За развитием ситуации внимательно следили в Москве и Верховный главнокомандующий Ельцин, и министр обороны Павел Грачев. Задача обеспечить вывоз Шеварднадзе из Абхазии была поставлена непосредственно Грачевым. Из Севастополя в срочном порядке вышел высокоскоростной десантный корабль «Зубр» на воздушной подушке под командованием капитана первого ранга Максимова. На корабле находилась рота морской пехоты, которую возглавлял полковник Корнеев. Руководил операцией непосредственно с командного пункта командующий флотом Эдуард Балтин, я находился рядом с ним.
В Сухуми в это время находилась рота ВДВ, но у нее к тому времени кончались боеприпасы и продовольствие, и она не могла оказать влияния на ситуацию. Планировалось, что воздушно-десантная рота выведет Шеварднадзе на берег и посадит на корабль. Естественно, все абхазские зенитные средства стояли вокруг аэродрома в ожидании взлета самолета Як-40 с Шеварднадзе на борту.
Надо сказать, что шум двигателей десантного корабля напоминает шум реактивного самолета. «Зубр» подошел ночью к берегу, и абхазы решили, что их атакует мощное российское авиационное соединение. Все средства ПВО были выведены на берег.
С корабля было видно сплошную линию огня, и к берегу подойти было невозможно. Корабль сделан из легко воспламеняемых сплавов и может получить пробоину, ведь стреляли прямой наводкой. «Зубр» несколько раз уходил обратно в море. Корабль все время менял направление ожидаемой высадки, кроме того, ночью его видно не было, слышно только мощный рев. Корабль всеми своими средствами вел огонь на поражение по берегу. Абхазские формирования, не понимая, с кем ведут бой, то пытались отражать удары авиации, то препятствовали высадке морского десанта. Воспользовавшись отвлечением сил и средств абхазской ПВО, пилоты Шеварднадзе подняли Як-40 и на очень малой высоте над рекой вышли в море, развернулись, ушли в сторону Поти и сели под Кутаиси…
Абхазские военные по сей день недоумевают, как единственный корабль создал такую панику. Хотя ровно через год после этих событий мы с Балтиным побывали в гостях у Ардзинбы в Сухуми. Он достаточно тепло нас принимал, был очень серьезный разговор о событиях годичной давности.
Так что своей жизнью Шеварднадзе обязан Черноморскому флоту».
Это опровергает бытующие байки типа: «… вывозили грузинского лидера из осажденного Сухуми на катере тоже американские спецназовцы (заверениям и российской, и абхазской сторон, будто он может беспрепятственно покинуть город, Шеварднадзе не поверил).»
Конечно, сам Шеварднадзе предпочел быть спасенным американцами. Находившийся в Сухуми во время штурма глава миссии ООН генерал Джон Хвидегард рассказывал, как члены грузинского правительства перед самым падением Сухуми собрались на берегу моря (на территории военного санатория) и стали в бинокли вглядываться в даль. Когда генерал спросил, что происходит, они начали его возбужденно убеждать, что вот-вот в Сухуми должен высадиться пятитысячный десант НАТО. Хвидегард заявил им об абсурдности этой информации, на что ему уверенно ответили, ну, мол, не пять, но две-три тысячи точно, просто генерал не в курсе. Между прочим, попавшие в плен в Сухуми грузинские военные были уверены, что в то время, как абхазы их атакуют в Гаграх, в Гудауте уже десантировались пришедшие к ним на помощь по призыву Шеварднадзе войска НАТО или ООН, которые с минуты на минуту должны войти в Сухуми.
Видимо, Шеварднадзе не только себя убедил в прямом западном военном вмешательстве, но и внушил эту мысль своему окружению, а те, в свою очередь, посеяли такие неоправданные надежды среди местного грузинского населения и армии. Справедливости ради стоит заметить, что в октябре 1993 г. в Черное море вошел крупный отряд Атлантической эскадры НАТО в составе восьми кораблей из европейских стран и одного корабля ВМС Канады, но этот отряд выполнил только визит в болгарский порт Варна и в сторону Кавказского побережья не двигался.