28 февраля Европейские наблюдатели от ОБСЕ и Европарламента признают прошедшие выборы не соответствующими международным нормам. Они указывают на попытки давления на избирателей со стороны, как президента, так и оппозиции, а также подкупа избирателей. Форум политических сил, объединяющий пять оппозиционных движений Киргизии, заявляет о нарушениях на избирательных участках в ходе голосования. Активисты оппозиции Роза Отунбаева, Топчубек Тургуналиев, Муратбек Иманалиев и Ишенгуль Болджурова заявляют, что в тех округах, где баллотировались представители оппозиции, были зафиксированы случаи массового подкупа голосов избирателей, использования административного ресурса, факты спаивания людей с корыстной целью и другие виды нарушения избирательного кодекса.
13 марта 2005 года прошёл второй тур парламентских выборов (где две недели назад ни один из кандидатов не смог набрать 50 %+ 1), по результатам которого абсолютное большинство мест в парламенте получили сторонники президента. 19 мандатов (из 75) в новом составе парламента будет принадлежать партии «Алга, Кыргызстан!» («Вперед, Киргизия!»), которую возглавляет дочь президента страны, 32-летняя Бермет Акаева. Ещё пять мандатов получили представители проправительственной партии «Адилет» («Справедливость»). В парламент прошли и несколько членов оппозиции — представители возглавляемого Розой Отунбаевой блока «Атажурт» («Отечество») — Омурбек Текебаев, Дооронбек Садырбаев, Болотбек Шерниязов, Муратбек Мукашев, один из лидеров Партии коммунистов Исхак Масалиев, а также член Народного движения Кыргызстана (НДК) Азимбек Бекназаров. Главной сенсацией стало поражение лидера НДК Курманбека Бакиева. Не хватило голосов и другому известному оппозиционеру — Адахану Мадумарову. Представители оппозиции составляют не более 10 % в новом составе парламента, и наблюдатели полагают, что они не смогут оказать серьёзного противодействия провластному большинству.
4 марта в Джалал-Абаде около тысячи человек собрались на несанкционированный митинг перед зданием администрации области. Основные требования манифестантов — отставка Акаева, местного губернатора Шарипова и главы ЦИК Сулаймана Иманбаева. Во второй половине дня оппозиционеры ворвались в здание администрации. Колонны людей движутся к Ошу — южной «столице» республики. Жители Нарынской области перекрыли стратегическую трассу, идущую к китайской границе. Около двух тысяч манифестантов в Нарыне выражают возмущение тем, что от участия во втором туре выборов был отстранен оппозиционный кандидат Ишенбай Кадырбеков.
7 марта стихийные митинги отмечены в городах Нарын и Талас. В Ошской области акции протеста охватили десятки населенных пунктов. Там формируются колонны, которые объединяются и двигаются пешим маршем к областному центру. Стратегическая автотрасса Бишкек — Ош парализована. По призыву местных лидеров оппозиции прямо на автомагистрали разбивают юрты, налаживают для участников марша горячее питание. Оппозиционное Народное движение Кыргызстана (НДК), возглавляемое Курманбеком Бакиевым, призывает президента Аскара Акаева немедленно подать в отставку и объявить о досрочных президентских выборах, а результаты нынешних парламентских выборов признать недействительными. НДК обращается к правоохранительным органам с призывом не применять оружие против мирных граждан и заявляет, что для предотвращения хаоса и анархии берёт на себя ответственность за координацию народных масс до достижения их главных требований.
Практически все участники собрания подвергают резкой критике действия властей во время проведения первого тура выборов, заявив, что руководство страны не контролирует ситуацию. Депутаты требуют отмены парламентских выборов, проведения досрочных выборов президента уже в июле 2005 года и продления сроков полномочий парламента 3-го созыва до осени.
15 марта. Недовольная результатами выборов оппозиция созывает в Джалал-Абаде курултай (всенародное собрание) жителей Джалал-Абадской области, на которой будут обсуждены их итоги. Объявленный митинг состоялся на площади перед зданием областной администрации в Джалал-Абаде. По подсчётам оппозиции, в нём участвовало несколько тысяч человек, по версии властей — не более тысячи. Митингующие прибыли из южных и центральных областей Киргизии с транспарантами «Долой Акаева!». Местная милиция и прочие представители силовых структур не вмешивались в происходящее. В президиуме курултая — лидеры оппозиции: бывший премьер Курманбек Бакиев, бывший министр иностранных дел Роза Отунбаева, бывший министр образования Ишенгуль Болджурова. Председателем курултая стал Азимбек Бекназаров, вновь избранный в парламент уже в первом туре выборов.
Согласно решениям, принятым на курултае, в Джалал-Абадской области создано параллельное официальным властям руководство. Председателем областного Координационного совета Народного единства Киргизии (КСНЕК) — «народного совета» — избран не прошедший в парламент Жусупбек Жээнбеков. Председателем КСНЕК по всему югу республики стал Усен Сыдыков. Решено провести курултаи и создать структуры КСНЕК в остальных регионах. На 16 марта аналогичное мероприятие намечено в другом областном центре, Таласе. Ещё одним решением Джалал-абадского курултая стало требование отставки президента страны Аскара Акаева. Его озвучили Курманбек Бакиев и Роза Отунбаева.
Массовые выступления оппозиции с требованием отменить итоги голосования проходят в городах Алай, Базар-Коргон, Кочкор и Таш-Кумыр.
16 марта. Власти Киргизии, встревоженные многочисленными акциями протеста, вынуждены идти на определённые уступки своим противникам. Речь идёт о возможном пересмотре результатов голосования в некоторых избирательных округах.
18 марта после полудня около 300 участников бессрочного митинга против фальсификации итогов парламентских выборов ворвались в здание областной администрации во втором по величине городе Киргизии Оше. Митингующие заняли здание и отказались покидать его до выполнения своих требований, главное из которых — отставка президента Аскара Акаева. Губернатора в здании не было, чиновникам было позволено беспрепятственно покинуть кабинеты.
Бессрочный митинг протеста начался и в Бишкеке. У памятника Максиму Горькому активисты партии «Ар-Намыс» (лидер — Феликс Кулов, который с 2000 года находится в заключении) заявили, что намерены установить в Бишкеке «подлинно народную власть, как это было в Джалал-Абаде». В Джалал-Абаде продолжает действовать «народный совет», образованный на съезде жителей области. Члены «народного совета» требуют передать им бразды правления. Губернатор области Жусупбек Шарипов, устроивший временную резиденцию в здании УВД, называет подобные действия нелегитимными, «противозаконными и уголовно наказуемыми».
20 марта. В пять часов утра в городах Джалал-Абад и Ош одновременно началась операция по освобождению зданий областных администраций. В здании в Оше в этот момент находилось около 100 человек, в Джалал-Абаде — около 300. В операции участвовали подразделения спецназа и местная милиция. В Джалал-Абаде на освобождение здания ушло около 20 минут. Спецназовцы, проникшие в здание через дверь и окна, хватали спящих людей, выносили из здания и заталкивали в два военных «КамАЗа». В здании возникли пожары от того, что обороняющиеся закидывали спецназ бутылками с бензином. Руководство МВД Киргизии заявило, что сотрудники правоохранительных органов не имели при себе огнестрельного оружия. По их словам, все задержанные были вывезены в фильтрационные пункты, где был проведён их осмотр, выяснение личности и медицинское освидетельствование. Сотрудники правоохранительных органов нашли в здании большое количество арматуры, дубинок, камней, которые власти намерены использовать в качестве вещественных доказательств. Аналогичным образом было освобождено и здание областной администрации в Оше. В ходе операции был задержан глава «народного совета» Ошской области Анвар Артыков, однако позже власти под давлением оппозиции были вынуждены отпустить его.