7 мая генерал Мане устроил ещё один путч. Его отряды заняли аэропорт, окружили президентский дворец и заставили его охрану сдаться. Президент Виейра укрылся в португальском посольстве, а затем был вывезен из страны вертолётом гвинейских ВВС.
Ансумане Мане стал председателем высшего совета военной хунты, передав гражданскую власть председателю Национальной народной ассамблеи Маламу Бакаи Санья. На выборах 2000 г. победил Кумба Яла, который распустил военную хунту. 23 ноября 2000 г. подразделения генерала Мане начали боевые действия против правительственных войск. Мятежники были выбиты из столицы, 30 ноября генерал Мане погиб в перестрелке в провинции Биомбо.
Две гражданские войны в Кот-д'Ивуаре (2002–2004 гг. и 2011 г.) также абсолютно не примечательны с точки зрения военного искусства, несмотря на широкое освещение их в мировых средствах массовой информации. Несомненно, что такое внимание мировой прессы ивуарийские конфликты заслужили, благодаря участию в них Франции. Французы поддержали президента Лорана Гбагбо в его борьбе против военных мятежников и северных повстанцев. Но обмен авиаударами двух стран 6 ноября 2004 г., в результате которого погибли 9 французских миротворцев, и был уничтожен весь небольшой авиапарк ВВС Кот-д'Ивуара, изменил политическую ситуацию, хотя ни к каким серьёзным последствиям тогда не привёл. Однако французы, видимо, так и не простили президенту Лорану Гбагбо эту бомбардировку. В новом конфликте, разразившемся в марте 2011 г., Франция, как и Совбез ООН, поддержала избранного в конце 2011 г. президента Алассана Уаттару, хотя Гбагбо не признал результаты выборов. 30 марта отряды Уаттары взяли столицу страны Ямусукро. 4 апреля и 10 апреля боевые вертолёты (два Ми-24 и один «Тигр») миссии ООН и французского контингента нанесли авиаудары по дворцу и резиденции Гбагбо в Абиджане, а также по армейским частям. 11 апреля Гбагбо был захвачен французским спецназом и передан сторонникам Уаттары.
Современная военная история этого региона началась в 1952 г. со знаменитого восстания «мау-мау» в Кении. Но большинство вооружённых конфликтов прошлось на долю Уганды. В этой стране до сих пор идёт война. Ещё две знаковые гражданские войны региона — в Бурунди (1993–2005 гг.) и в Руанде (1990–1994 гг.). Однако, несмотря на ужасающее количество жертв, эти конфликты между этническими группами тутси и хуту войнами можно назвать лишь формально.
Тактика повстанцев «мау мау» не выходила за рамки террора против белых колонистов и лояльных британской короне африканцев. Основу повстанческих отрядов составили представители племени народа кикуйю. Британская колониальная администрация сразу исключила любые политические методы как способ решения проблемы «мау-мау», ставка была сделана на жесткое подавление восстания. Чёткое понимание цели, несомненно, способствовало успеху всей военной кампании (1952–1963 гг.), которая проводилась с учётом опыта недавней успешной военной операции британской армии в Малайе.
Партизанские зоны — леса около горы Кения, а также современные национальные парки Эбурру и Абердэр — изолировались, деревни, жители которых подозревались в сочувствии к мау- мау, переселялись, усиленно велась «борьба за сердца и умы», в частности, широко пропагандировалась версия, что кикуйю хотят захватить власть в стране.
Из числа лояльных африканцев и дезертиров мау-мау формировались отряды, которые действовали против повстанцев чуть ли не с большим успехом, чем британские части. Совершенно особенными формированиями, ставшими своеобразной визитной карточкой этой войны, были смешанные отряды, в которых британские белые офицеры и сержанты маскировались под африканцев с помощью краски и парика. Эти спецкоманды отличались высокой эффективностью в сборе разведданных, диверсиях и провокациях, а так же в борьбе против небольших групп повстанцев.
Уже за первый год войны большие отряды повстанцев были рассеяны, они стали действовать небольшими группами. Их подпольная сеть в Найроби была разгромлена. Максимальная численность британских войск вместе с местными вспомогательными частями в ходе войны в Кении составляла более 50 тысяч человек. Контрпартизанские операции проводились при поддержке штурмовой авиации, артиллерии и бронетехники. Но природное искусство маскировки и отличное знание местности помогали мау-мау уходить от преследования и продолжать борьбу. Тем не менее, во второй половине 1950-х восстание мау-мау было фактически подавлено, хотя последние отряды вышли из леса только в декабре 1963 г. после провозглашения независимости.
Другим масштабным конфликтом в регионе стала угандийскотанзанийская война (1978–1979 гг.). Угандийский диктатор Иди Амин объявил войну Танзании 1 ноября 1978 г., используя как предлог поддержку Дар-эс-Саламом угандийской оппозиции. В Танзанию ушли восставшие против него в октябре армейские части, где они объединились с политическими оппонентами Амина. Официальной целью кампании Амин объявил аннексию танзанийской области Кагера, которая по его мнению, исторически принадлежала Уганде. Танзанийский президент Джулиус Ньерере в короткий срок провёл мобилизацию, доведя численность своих войск с 40 до 100 тысяч. К ним присоединились угандийские оппозиционные группы, объединившиеся в Национальную освободительную армию Уганды (НОАУ). Продвижение частей регулярной армии Уганды было остановлено в 30–40 км от границы, после двух недель интенсивных боёв с применением бронетехники, они стали отступать, и к концу ноября покинули территорию Танзании. В январе 1979 г. войска Танзании при поддержке НОАУ вторглись в Уганду.
Основной ударной силой войск Амина стали посланные ему на помощь Муамаром Каддафи ливийские части (2,5 тысячи) действовавшие при поддержке танков Т-54 и Т-55, реактивных систем залпового огня БМ-21 «Град», истребителей МиГ-21 и дальних бомбардировщиков Ту-22. Угандийские части стойкостью не отличались.
Единственное серьёзное сражение этой кампании произошло севернее Лукайи. Наступающие на Кампалу танзанийские части остановились перед обширной, сильно заболоченной местностью. 201-я бригада была послана прямо через болото по гати, 208-я бригада стала обходить болото с запада. Ливийская бригада с 15 танками Т-55 в этот момент двигалась на Масаку и 10 марта вошла в боевое соприкосновение с 201-ю бригадой армии Танзании. В результате боя танзанийцы отступили в беспорядке. В ночь с 11 на 12 марта танзанийцы контратаковали с двух направлений (201-я с юга и 208-я с северо-запада) и обратили противника в бегство.
10 апреля 1979 г. столица страны пала. Сопротивления почти не было. Амин бежал в Саудовскую Аравию. Ливийцы отступили в Джинджу и были репатриированы через Кению и Эфиопию.
Танзанийские войска покинули территорию Уганды в июне 1981 года. Вслед за этим в стране разразилась кровавая гражданская война (1981–1986 гг.), в результате которой она перешла под контроль повстанческой Национальной армии сопротивления под командованием Йовери Мусевени, который до настоящего момент остается президентом Уганды.