Тем временем шведы понесли ряд поражений в Польше. По условиям договора 1660 года между Речью Посполитой и Швецией шведские границы в Прибалтике отодвигались к северу от Даугавы. Латгалия переходила под власть Речи Посполитой.
После заключения договора со Швецией Речь Посполита возобновила войну против России. Король Ян Казимир занял Вильнюс, Гродно, Новогрудок. По Андрусовскому перемирию 1667 года Россия вернула себе Смоленск, Северскую землю с Черниговым и Стародубом. Речь Посполита признала воссоединение России с Левобережной Украиной. Царь Алексей Михайлович отказывался от притязаний на Литву, удержавшую за собой Полоцк и Витебск. Позже условия перемирия были подтверждены так называемым Вечным миром 1686 года.
Все эти бурные события XVII столетия ослабили Речь Посполиту и особенно Литву. Как отмечалось в «Истории Литовской ССР», «во второй половине XVII века начался хозяйственный упадок Великого княжества Литовского, который был обусловлен общеевропейской экономической депрессией и осложнен усилением крепостнической эксплуатации крестьян. Он усугублялся военными разрушениями — неизбежным следствием восточной экспансии литовских феодалов, войны с Россией и Швецией в середине XVII века. Усилившаяся национально-освободительная борьба украинского и белорусского народов в значительной степени способствовала ослаблению Великого княжества Литовского… Восточные районы страны были наиболее разорены в середине XVII века. Повсюду предельно сократилась запашка земель. Не хватало скота и рабочих рук. Крестьяне постоянно голодали».
«В результате войн пришли в упадок и города. Налоги, военные контрибуции, огромные долги парализовали их жизнь. Началось массовое бегство населения из городов… С середины XVII века Великое княжество Литовское переживало демографический кризис. В 1648 году в стране было около 4.5 миллиона населения, а к 1667 году — 2,3 миллиона, т. е. осталось немногим более половины».
Крайне низким оставался уровень образованности. Как отмечалось в «Истории Литовской ССР», «оставалось малограмотным большинство шляхты. Акты конфедерации шляхтичи зачастую подписывали тремя крестиками. Но они держались высокомерно по отношению к простому народу и, как видно из отчетов епископов Жемайтии в Рим, не посещали костелов, в которых богослужение велось на литовском языке. Ополяченная шляхта с презрением относилась не только к народу, но и к его культуре и языку… С укреплением католицизма усилилась полонизация края. В 1697 году государственным языком был объявлен польский».
В течение полутора столетий после крушения Ливонского ордена народы Эстонии и Латвии оставались под властью немецких баронов. Но их рабство было усилено колониальным режимом Швеции и Польши. В то же время бурные события полутора столетий привели к созданию литовско-польской конфедерации, что усилило полонизацию правящих верхов Литвы и привело их к острой конфронтации с русским, белорусским и украинским народами. В результате же драматических и кровавых событий XVII века Великое княжество Литовское, некогда претендовавшее на роль вершителя судеб в Восточной Европе, к концу столетия влачило жалкое существование, находясь на положении бедного родственника и неравноправного партнера слабевшей Речи Посполитой. Шляхетская же верхушка Великого княжества утрачивала связи с народом Литвы, ее национальной культурой и ее языком.
Упадок Литвы и ослабление Речи Посполитой совпали с укреплением России, которая после окончания неудачной для нее Ливонской войны, а затем Смуты и периода шведской и польско-литовской интервенции сумела восстановить и нарастить свои силы. Пока западные соседи России пытались под идейным руководством папы римского осуществить поход на Восток, русские люди дошли до крайних северо-восточных пределов Евразии и создали крупнейшую в мире континентальную державу. Как и 150 лет назад во времена Ивана Г розного, Россия в конце XVI! века ставила вопрос о выходе на Балтийское море. Однако теперь препятствием к этому была не слабая Ливония, а мощное западноевропейское государство — Швеция.
Во время своего Великого посольства в Европе царь Петр I старался создать антишведскую коалицию с Речью Посполитой, Саксонией и Данией. В 1698 году Петр I договорился с королем Польши и курфюрстом Саксонии Августом II о совместных действиях против Швеции, В 1699 году было достигнуто такое же соглашение Петра I с королем Дании.
В соответствии с соглашением Август II, решив действовать без разрешения сейма Речи Посполитой, направил в 1700 году саксонские войска в шведскую Прибалтику. В феврале 1700 года войско Августа II появилось под Ригой.
Несколько позже войска Петра I осадили Нарву. Тем временем войска короля Дании Кристиана V вторглись во владения союзника Швеции герцога Гольштейнского.
Однако шведский король Карл XII ответил решительными действиями, высадив 15-тысячный десант под Копенгагеном и добившись капитуляции Дании. Подписав в ноябре 1700 года мирный договор с Данией, Карл XII перебросил войска к Нарве, а затем внезапно атаковал русские войска и разгромил их. После этого Карл XII направил все свои силы против саксонских войск Августа. В начале 1701 года Карл XII овладел всеми крепостями в Лифляндии, которые до этого взяли саксонцы. Более того, Карл XII вознамерился свергнуть Августа II с престола и при содействии Польши, Турции и крымских татар начать войну против России.
9 марта 1701 года Петр I и Август II встретились в замке Биржай, где договорились о дальнейших совместных действиях. Однако вскоре шведы наголову разбили саксонские войска, вошли в Жемайтию и достигли Каунаса и Кедайняя. 25 марта 1702 года войска Карла взяли Вильнюс. Август II предложил Карлу XII мир, но тот не пожелал его, продолжая наступать. Войска Карла XII вступили в Польшу, 24 мая 1702 года заняли Варшаву, а затем Краков.
Одновременно шведы расширяли свой контроль над Литвой. Как написано в «Истории Литовской ССР», «в Великом княжестве Литовском генерал Мернер, командовавший гарнизоном оккупантов, грабил население, собирая тяжелые военные контрибуции. Здесь разгоралась партизанская борьба, в которой активное участие принимали крестьяне. Против интервентов вели бои и отряды регулярной армии. В Литве образовались два лагеря шляхты: один под руководством вновь назначенного гетмана М. Вишневецкого и его заместителя Г. Огиньского, поддерживавший союз Речи Посполитой с Россией, и второй — во главе с отстраненным от власти К. Сапегой, выступавший в поддержку Швеции. Большинство шляхты пошло с М. Вишневецким… Конфедерация шляхты в Вильнюсе (1703 г.) поддержала Августа II в его войне против Швеции… 28 июня 1703 года был подписан договор между представителями Вильнюсской конфедерации и Россией. Обе стороны обязались не заключать со Швецией сепаратного мира».
Летом 1704 года был возобновлен союз Петра I с Августом II. А вскоре начались бои в Литве, в ходе которых литовские войска действовали сообща с русской армией. Воспользовавшись тем, что наибольшие силы шведских войск находились в Польше, Петр I летом 1704 года занял Тарту, Нарву, а затем и всю Лифляндию. В ноябре 1704 года русские войска взяли Вильнюс.