Тем не менее 27 мая 1997 г. НАТО и Россия подписали Основополагающий акт, который был призван поставить их отношения на прочную договорную основу. В этом документе стороны заявили, что не рассматривают друг друга в качестве противников и дают обязательство не применять силу или угрозу силой в отношениях между собой. В соответствии с достигнутой договоренностью был создан консультативный механизм — Совместный постоянный совет Россия — НАТО (СПС). Этот орган должен был максимально обеспечить претворение в жизнь совместных решений. Основополагающий акт не ограничивал суверенитета сторон в вопросах обороны. Для России это означало, что она лишена возможности влиять на процесс расширения альянса, равно как и на другие аспекты военной политики НАТО. Функции СПС предусматривали не только проведение консультаций, но и в случае согласия сторон — совместное выдвижение инициатив в сфере международной безопасности, а также осуществление совместных миротворческих операций по мандату СБ ООН. Предполагалось, что СПС будет работать на регулярной основе, что не исключало проведения чрезвычайных сессий по требованию любой стороны. Планировалось иметь три сопредседателя: со стороны России, одной из стран альянса и генерального секретаря НАТО. Были также предусмотрены регулярные заседания с участием министров иностранных дел и обороны, а также ежемесячные встречи на уровне постоянных послов при СПС. Не исключалось и проведение заседаний СПС на высшем уровне. Предполагалось создать и постоянно действующие рабочие органы — комитеты и рабочие группы по различным политическим и военным вопросам.
В документ были включены положения, которые несколько ослабляли военные последствия расширения НАТО. Так, НАТО брала обязательство не размещать на территории новых членов ядерное оружия. В документе содержалось положение о сохранении размеров пределов, установленных для НАТО договором ОВСЕ. Таким образом, после вступления в альянс новых членов общая численность вооруженных сил и вооружений НАТО не должна увеличиваться. Согласно принятым обязательствам, альянс не должен выполнять свои функции по осуществлению коллективной обороны «путем дополнительного постоянного размещения существенных боевых сил». Реально содержание этой формулы предстояло уточнить на переговорах по адаптации Договора ОВСЕ.
В Основополагающем акте были согласованы меры по развитию сотрудничества между военными структурами России и НАТО. Планировалось осу. ществлять обмен информацией по вопросам военных доктрин, стратегии, состава и оснащения вооруженных сил, а также проведения совместных учений. Предусматривалась возможность проведения совместных миротворческих операций по мандату СБ ООН или ОБСЕ.
Этот документ получил противоречивую оценку со стороны различных государств и политических деятелей. В России многие политики считали, что этот документ закладывает реальные основы для эффективного, а не декларативного военно-политического сотрудничества России и НАТО, что Основополагающий акт сводит к минимуму негативные' последствия расширения альянса. Кроме того, в России полагали, что данный документ — не просто декларация, а юридическое обязательство, несмотря на то что акт Россия — НАТО не подлежал ратификации.
Президент США Б. Клинтон охарактеризовал этот документ как «исторический шаг к созданию мирной, единой демократической Европы». Но, с другой стороны, тогдашний госсекретарь США М. Олбрайт исходила из того, что заверения, данный России, не являются юридически обязывающими и могут стать предметом изменений, если изменится ситуация в Европе. Кроме того, она полагала, что НАТО сможет в своих целях и на свое усмотрений использовать военные базы, оставшиеся после распада ОВД.
К негативным последствиям подписания Основополагающего акта следует отнести и то, что Россия пусть косвенно, но признала неизбежность расширения НАТО, а сам документ хотя и призван был минимизировать последствия расширения НАТО, однако устранить их полностью он был не в силах. Этот момент был отмечен даже в китайской прессе, где обращалось внимание на то, что «вскоре за первым этапом расширения НАТО последует второй и третий. В результате Россия может утратить контроль над постсоветским географическим и политическим пространством, чего и добиваются на Западе».
В течение первого года взаимоотношений Россия — НАТО на основе совместного документа стали развиваться связи по военной линии. Появились предпосылки для включения России в военно-техническое сотрудничество с НАТО. Проведено несколько заседаний Совместного постоянного совета (СПС) в рамках Основополагающего акта Россия— НАТО. Состоялись встречи министров обороны и министров иностранных дел. Таким образом, Основополагающий акт способствовал повышению уровня отношений с НАТО, который отличался от простого участия в программе «Партнерство ради мира». 18 марта 1998 г. открылось представительство России при НАТО.
Однако, как вынужден был уже тогда отметить начальник Главного управления международного военного сотрудничества Генерального штаба ВС РФ генерал-полковник Л.Г. Ивашов, «первые заседания СПС показали, что натовцы не настроены обсуждать серьезные вопросы, они с удовольствием дискутируют по проблемам войскового взаимодействия в Боснии и Герцеговине, они готовы анализировать и обсуждать ход сотрудничества в рамках программы «Партнерства ради мира» и другие, как бы легкие вопросы».
Обращает на себя внимание обстоятельство, что в связи с подготовкой и подписанием Основополагающего акта в СМИ появилось немало опасений по поводу «российской угрозы». В частности, по мнению натовских аналитиков, военную опасность альянсу представляли наличие крупной группировки российских войск на Кольском полуострове и территориальные противоречия между Россией, Норвегией и Финляндией. В альянсе полагали, что хотя их обострение маловероятно, тем не менее при определенных условиях они могут привести к ухудшению отношений России с этими странами и появлению предпосылок для возникновения вооруженного конфликта. Беспокойство в НАТО вызывали не совсем стабильные взаимоотношения России с прибалтийскими государствами. Не исключалось, что причинами возникновения напряженности могут стать разногласия и спорные вопросы, связанные с проживанием в странах Балтии русскоязычного населения, а также территориальные притязания стран Балтии к России.
С другой стороны, как полагали в НАТО, существует опасность выдвижения территориальных претензий к другим республикам бывшего СССР. В большей степени это касается Украины. На ее территорию могут претендовать сразу несколько государств: Польша Словакия, Венгрия и Румыния. Такая же проблема может возникнуть и у Беларуси. Польша может претендовать на часть Гродненской, Брестской и Минской областей. У России свои проблемы с Украиной из-за Крыма и других пограничных территорий.
Таким образом, НАТО рассматривает Россию как возможный очаг локального конфликта и, следовательно, потенциального противника. Прямое столкновение между Россией и альянсом в Брюсселе и Вашингтоне разыгрывалось в сценариях локальных или даже крупномасштабных войн, причем развязывала их, как правило, российская сторона. Характерным в этом плане является разработанный Пентагоном вариант нападения России на Литву, затрагивающий жизненно важные интересы США. Ответом на «агрессию» становится прямое участие ВС США и их союзников в боевых действиях, в которых может быть задействовано до 8 натовских дивизий.